有一定比例的列的Bash -过滤器行

Question

所以，我有大量的文件，每个文件有8列和很多行。这是其中一个人的脑袋，举个例子。

ID       Ct       1          2          3          4           5             6
1        0        consensus  -          -          -           -             -
2        0        consensus  -          -          -           -             -
3        0        consensus  consensus  consensus  consensus   consensus     consensus
4        0        consensus  -          consensus  -           -             -
5        0        -          AT         AT         GC          GC            AT
6        0        consensus  -          -          -           consensus     -
7        0        consensus  -          -          -           -             -
8        0        consensus  consensus  consensus  -           consensus     consensus
9        0        consensus  -          -          -           -             -

我想将最后6列至少占5/6的所有行分开。所以ID 3，5和8(第4，6和9行)从我的头上。因此，我希望所有列少于2列的行都有效地使用"-“。

我以前用一个简单的awk脚本就能做到这一点，因为程序计算了第二列占据了多少列--似乎我不能再这样做了。做这件事最好的方法是什么？

Answer 1

会有多远

awk 'gsub(/-/, "&") < 2' file
ID       Ct       1          2          3          4           5             6
3        0        consensus  consensus  consensus  consensus   consensus     consensus
5        0        -          AT         AT         GC          GC            AT
8        0        consensus  consensus  consensus  -           consensus     consensus

抓到你了？请注意，没有说什么，rg。所需的输出--您想要一个单独的输出文件、以输出行为前缀的文件名，还是使用与原始文件类似的名称的新文件？

编辑(在对新文件名进行注释后)：

awk 'gsub(/-/, "&") < 2 {print > (FILENAME ".new")}' /path/to/file/*