查找两个文件之间的常见模式

Question

我有两个文件，file1有一个列，600行，file2有20列和3000行。我想从file1中找到在file2中常见的模式。

file1：

K00001
K00002
K00003
K00006
K00013
K00025
K00089

file2：

TRINITY_DN102283_c0_g1  KEGG:xtr:496432`KO:K16860
TRINITY_DN42420_c0_g1   KO:K01762
TRINITY_DN52581_c0_g1   KEGG:zma:732844`KO:K13523
TRINITY_DN36387_c0_g2   KEGG:zma:732811`KO:K00089
TRINITY_DN54650_c4_g1   KEGG:zma:542598`KO:K00025
TRINITY_DN93494_c0_g1   KEGG:zma:542598`KO:K00025
TRINITY_DN36051_c0_g1   KEGG:zma:542598`KO:K00025

我希望得到这样的结果：

K00025
K00089

Answer 1

您可以使用以下代码片段来完成此操作

grep -f file1 -o file2 | sort -u
K00025
K00089

Answer 2

comm -12 <(grep -oP '\w+' a|sort -u) <(grep -oP '\w+' b|sort -u)

其中：

• grep -oP '\w+' a|sort -u获取a文件中单词的排序列表。
• 文件b的一些
• comm -12输出公共行