LSF平台上的文档

Question

我试图在通过bsub传递给Platform LSF的命令中执行进程替换。

在我提交作业的worker节点上，没有启用进程替换，因为它不是符合POSIX的特性。

因此，我需要启用该特性，然后从bsub内部提交第二个进程。我用这里的文档来完成这个工作，然而，它也不是没有错误的。没有读取最终的EOF标记，即warning: here-document at line 4 delimited by end-of-file (wanted 'EOF')

set +o posix;
bash <<EOF
    some.program -1 <(gunzip -c some.file) -2 <(gunzip -c some.file);
EOF

作为单个字符串提交给bsub，例如set +o posix;\nbash <<EOF\nsome.program -1 <(gunzip -c some.file) -2 <(gunzip -c some.file);\nEOF

对于如何让最终的EOF被正确阅读，有什么建议吗？正如我说的，一切都很好，所以这只是整理代码的一个例子。

Answer 1

shell需要在完整的行中单独使用EOF字符串，只需在它之后添加一个\n ( mybe : after也可以帮助)：

set +o posix;\nbash <<EOF\nsome.program -1 <(gunzip -c some.file) -2 <(gunzip -c some.file);\nEOF\n:

注意:我的意思是这是一个评论，但在评论中没有足够的空间来完整地写这篇文章。