如何在gridengine中以根用户身份运行序言脚本？

Question

在我们的一个计算集群中，我们拥有具有独特硬件资源的系统，这些系统的访问由设备文件权限控制。每个节点都有其中的两个或四个，以及多个CPU核心。我们希望能够在同一个节点上调度不同用户的作业，并限制对正确分配的资源的访问。(有些队列甚至可能仅限于CPU，没有访问权限。)

有一段时间，我们的政策是“嘿，注意并表现得很好”，但这对每个人来说都是很难做到的，即使是出于最好的意图。因此，我们只是一次为给定的用户调度整个节点。对于单线程的单进程任务来说，这是浪费的。

有了扭矩，就可以在作业开始前运行作为根的序言脚本。这可以适当地设置设备权限。但我们正在运行(née Sun)网格引擎。这有每个队列的prolog脚本，但是它们作为作业所属的用户运行(比如Torque的prologue.user)，这在这里是没有帮助的。

有什么明显的东西我错过了(我希望)，或者一个替代的方式来解决这个问题？我意识到我有源代码，因此可以做任何事情，但我希望有一个标准的方式，我只是错过了。

谢谢!

Answer 1

prolog脚本实际上可以作为任何用户运行。

来自man queue_conf：

prolog :在执行Grid引擎作业之前启动的shell脚本的可执行路径，其环境设置与以后将启动的Grid引擎作业相同。可选前缀" user @“指定要启动此过程的用户。

因此，设置prolog root@/path/to/prolog应该让它作为根用户执行。