无法完成pdftools安装Ubuntu18.04的R支持阅读文本

Question

我读了如何安装波卜勒的帖子，对自己的困难满怀希望，但没有掷骰子。

我在Ubuntu18.04精密笔记本电脑上运行Anaconda下的R。我想安装readtext (R包)来支持一些语料库语言学研究，并试图从R终端窗口实现。我已经在没有问题的情况下安装了quanteda，所以当阅读文本被pdftools要求绊倒时，我感到很惊讶。

cannot find -lpoppler-cpp

我已经安装和卸载libpoppler dev几次使用

sudo apt-get install -y libpoppler-cpp-dev

安装好了

libpoppler-cpp-dev is already the newest version (0.74.0-bionic0)

当我尝试从R安装readtext (再次运行在Anaconda下，这可能是问题)时，它会到达pdftools安装并找到本地pkg-config信息。

• 安装源代码包‘pdftools’.*包‘pdftools’成功地解压缩，MD5和检查**使用分段安装找到pkg-配置标记和lib！使用PKG_CFLAGS= -I/usr/include/poppler /cpp -i/usr/include/poppler使用PKG_LIBS=-lpoppler

但却找不到：

/home/dalton/anaconda3/bin/../lib/gcc/x86_64-conda_cos6-linux-gnu/7.3.0/../../../../x86_64-conda_cos6-linux-gnu/bin/ld:无法找到-lpoppler: collect2: collect2: ld返回一个退出状态：* /home/dalton/anaconda3/lib/R/share/make/shlib.mk:6: pdftools.so错误1错误:程序包“pdftools”编译失败

• 去除‘/home/dalton/anaconda3/lib/R/library/pdftools’

当我亲自检查pkg-config时：

pkg-config --cflags --libs poppler-cpp

-I/usr/include/poppler/cpp -I/usr/include/

我确实找到了R中的安装程序所找到的相同信息。当我用系统grep追赶poppler时：

ls --recursive | grep -E "poppler"

我没有找到poppler，虽然我找到libpoppler和其他libpoppler文件/文件夹。但是，如果我询问pkg-config：

pkg-config --cflags --libs libpoppler-cpp-dev

它告诉我

在pkg-config搜索路径中找不到包libpoppler。也许您应该将包含‘libpoppler-cp-dev.pc’的目录添加到PKG_CONFIG_PATH环境变量中。没有找到‘脂器-cpp’的包裹。

我在上面引用的SE帖子中使用了@jeroen推荐的Poppler0.74.0支持Ubuntu18.04(仿生)的PPA，但是在Ubuntu本身和Anaconda R之间似乎有些混淆，因为R安装是在寻找Poppler，但是libpoppler似乎是合适的目标。因为我在Anaconda下运行R，我的系统似乎不知道R：

apt-cache policy r-base-core

返回

R基核心:已安装：(无)候选: 3.4.4-1ubuntu1版本表:3.4.4-1ubuntu1500 http://us.archive.ubuntu.com/ubuntu仿生/宇宙amd64软件包

我意识到这有点混乱，但我希望有人能认识到一个明显的问题，并告诉我要黑什么，例如修改poppler-cpp.pc来指向新的库或类似的东西。

Answer 1

解决方案是留在Anaconda/conda环境中，因为R正在运行，而这是Ubuntu海周围的一个小岛(如果这个比喻没有让您晕船的话)。就这么做

conda install -c conda-forge poppler

这需要很长时间才能完成，因为最初两次“解决环境”的计划失败了，但是conda最终尝试了另一个重新数据源并成功了：

package                    |            build
---------------------------|-----------------
certifi-2019.9.11          |           py37_0         147 KB  conda-forge
conda-4.10.1               |   py37h89c1867_0         3.1 MB  conda-forge
openjpeg-2.3.1             |       h21c5421_1         469 KB  conda-forge
poppler-0.65.0             |       h581218d_1         1.3 MB
poppler-data-0.4.10        |                0         3.8 MB  conda-forge
python_abi-3.7             |          1_cp37m           4 KB  conda-forge
------------------------------------------------------------
                                       Total:         8.7 MB

等等，以祝福结束

执行事务:已完成

然后我打开了一个终端窗口并启动了R：

dalton@dalton-精度-3541:R

R版本3.6.1 (2019-07-05) -“脚趾的行动”版权(C) 2019统计计算平台R基金会: x86_64-conda_cos6-linux-gnu (64位)

并安装了pdftools：

> install.packages("pdftools")

• 安装源代码包‘pdftools’.*包‘pdftools’成功地解压缩，MD5和检查**使用分段安装找到pkg-配置标记和lib！使用PKG_CFLAGS= -I/usr/include/poppler /cpp -i/usr/include/poppler使用PKG_LIBS=-lpoppler

对那些感兴趣的人来说，Anaconda库文件位于以下领域

-lpoppler cpp-L/home/dalton/anaconda3 3/lib/R/lib -lR

换句话说，在poppler的conda安装之后，我的pdftools的R安装可以找到poppler。完成pdftools：

**测试是否已安装包保存了临时安装路径的记录

• 已完成(pdftools)

然后，我完成了安装readtext的最初任务，这需要poppler和pdftools：

install.packages("readtext")

**测试是否已安装包保存了临时安装路径的记录

• 已完成(阅读文本)

下载的源代码包在‘/tmp/Rtmpxksozx/ downloaded _ packages’中更新“.Library”中生成'packages.html‘的包的HTML索引。完成

图书馆(读本)

一切与世界都是好的，在Ubuntu内部有着错综复杂的Anaconda/conda世界。这是一个伟大的环境，科学和学术计算，一旦你知道如何沟通。