conda激活在bash文件中不工作

Question

我正在尝试编写一个名为myscrpt.sh的脚本，所以当我运行它时，它会自动创建一个虚拟env并使用conda激活它。我的conda版本是4.7.1。

这就是我在myscrpt.sh开始时所拥有的：

#!/bin/bash
conda create --name myenv1
conda activate myenv1

创建环境不是问题，但是我得到了错误：

CommandNotFoundError:您的shell没有被正确配置为使用“conda”。要初始化您的shell，运行$ conda init 当前支持的shell是：- bash - fish - tcsh - xonsh - zsh - powershell -参阅'conda init --帮助‘以获得更多信息和选项。注意:在运行“conda init”之后，您可能需要关闭并重新启动shell。

如果我直接在我的终端中运行conda activate myenv1，我就不会得到这个错误。

到目前为止，我已经采取了一些措施，例如使用conda init ，这一点都没有帮助。然后，我在bashrc中添加了以下内容

# >>> conda initialize >>>
# !! Contents within this block are managed by 'conda init' !!
__conda_setup="$('/home//anaconda3/bin/conda' 'shell.bash' 'hook' 2> /dev/null)"
if [ $? -eq 0 ]; then
    eval "$__conda_setup"
else
    if [ -f "/home//anaconda3/etc/profile.d/conda.sh" ]; then
        . "/home//anaconda3/etc/profile.d/conda.sh"
    else
        export PATH="/home//anaconda3/bin:$PATH"
    fi
fi
unset __conda_setup
# <<< conda initialize <<<

也不起作用。接下来，根据此链接，将路径行中的路径更改为：

. /opt/conda/etc/profile.d/conda.sh
conda activate base

这是为conda 4.4写的，但我希望能帮上忙。

然后我尝试了conda run而不是conda activate，但这也没有帮助。

那么，我有什么想法可以让它发挥作用呢？)

UPDATE1:现在我使用source ./myscript.sh，激活工作很好，但是它会导致conda install中的错误。

Answer 1

任一

1. 将eval $(conda shell.bash hook)添加到脚本中，或
2. 用bash -i调用脚本来调用交互式环境

Answer 2

在此问题中给出的另一个解决此错误消息的方法是：

source activate base

因此，一个完整的例子可以是：

#!/bin/bash
conda create --name myenv1
source activate base 
conda activate myenv1

Answer 3

在Ubuntu焦点，这是唯一的方法，为我工作。

假设您的env安装在~/miniconda3目录中。

source ~/miniconda3/etc/profile.d/conda.sh
conda activate myenv