无法配置或使安装samtools 0.1.19

Question

我需要安装一个特定版本的samtools (0.1.19) (在https://sourceforge.net/projects/samtools/中找到)。

/配置返回“没有这样的文件.”“make”正确(据我所知)返回" make：*没有规则使目标‘安装’。停止。“

不同的版本很好。我完全迷路了，自述引擎没有提供任何帮助，我也不知道在makefile中发现任何问题。在几个小时的失败尝试之后，任何帮助都会受到极大的感谢.

Answer 1

实际上，您不需要自己编译这个应用程序。

在宇宙口袋中所有当前支持的版本中，它都是被包装。

您可以使用(如果没有启用)命令添加这个口袋：

sudo add-apt-repository universe

然后您可以简单地用以下方式安装它：

sudo apt-get install samtools

如果您真的想编译samtools，那么您不需要运行./configure脚本(因为它不存在)，只需使用make：

cd ~/Downloads
wget https://vorboss.dl.sourceforge.net/project/samtools/samtools/0.1.19/samtools-0.1.19.tar.bz2
tar -xf samtools-0.1.19.tar.bz2
cd samtools-0.1.19
make

你会得到：

$ ./samtools方案: samtools ( SAM格式的对齐工具)版本:0.1.19-44428 in使用: samtools 选项命令: viewer <-> BAM转换排序排序比对文件multi多向堆积深度计算深度FASTA tview文本对齐索引索引对齐idxstats BAM索引状态(r595或更高版本)修复伴侣信息，标记，简单统计，冷静，重新计算MD/NM标签和'=‘基础，合并，排序，排序，rmdup，删除PCR重复，重新标头，替换BAM标头，猫连接bedcov，每床区域读取深度，目标切割窝中间区域(仅用于磷池)阶段阶段。杂合子bamshuf杂合子洗牌和按名称对齐