Mothur 39.5的问题(没有找到makefile )

Question

我对UBUNTU和Mothur都是新手。我正在尝试安装从https://github.com/mothur/mothur/releases (Mothur.linux_64.zip)下载的39.5 Mothur版本。我跟踪了Mothur公司提供的安装管道：

 mkdir mothur
 cd mothur
 unzip ../Mothur.source.zip
 make

但我知道这个错误：

make: *** No targets specified and no makefile found.  Stop.

我进入了文件，我找不到任何制作文件(Blast，CatchAllCmdL.exe，LICENSE，mothur，the，vsearch )。我可以尝试使用：

Sudo apt install mothur

但是，它只安装了以前的version.If，有人可以帮上忙！

谢谢

Answer 1

Mothur.linux_64.zip包含已编译的可执行文件。您不必构建它，您可以直接运行它。如果已将cd编辑到包含也称为mothur的文件的未打包的mothur目录，则只需运行以下命令：

./mothur

您可能希望将mothur目录解压缩(或移动已打包的目录)，然后在PATH中的某个地方放置一个指向该mothur可执行文件的符号链接。

如果您能够运行该程序，但又需要有关如何使用它的信息，则可以在它提供的提示符中键入help()，其中列出了所有可用的命令以及文档的链接。

如果您真的想从源代码编译它，那么您必须下载源代码，就像皮姆一样，您可以在下载页面上获取标记为“源代码”的.tar.gz文件。但基于你的要求，我没有理由认为你真的需要或想要。有了您所拥有的，您应该能够运行该程序；它已经为您编译了，所以您不需要首先编译它。

Answer 2

或者只需从包存储库安装它(也可用于Debian)：

sudo apt-get update
sudo apt-get install mothur