更改.fasta文件名

Question

我有像2000 fasta文件这样的结构：

Name_ID#_Name2_ID1...2000.fasta

我想将文件名的顺序更改为：

Name2.Name_ID#_ID1...2000.fasta

有人对我如何做到这一点有建议吗？

Answer 1

解决这个问题有很多种方法。一种办法是：

#!/bin/bash

for i in *.fasta; do
    tokens=( $(echo "${i}" | sed -e 's/_/ /g') )
    newName="${tokens[2]}.${tokens[0]}_${tokens[1]}_${tokens[3]}'"

    echo "mv ${i} ${newName}"
done

此脚本循环遍历以.fasta结尾的当前目录中的每个文件；每次通过循环，变量${i}都包含当前文件名。

接下来，脚本使用sed将下划线(_)更改为文件名中的空格，并将其存储为令牌数组。对于一个名为Name_ID1_Name2_ID1000.fasta的文件，您的结果是：

tokens[0]='Name'
tokens[1]='ID1'
tokens[2]='Name2'
tokens[3]='ID1000.fasta'

接下来，脚本根据这些令牌和您对所需顺序的描述创建newName。最后，脚本打印用于执行重命名的mv命令。

如果你运行这个脚本，它会打印它会做什么。你可以检查它，以确保它是你想要的行为。如果是这样，则可以删除echo：

mv "${i}" "${newName}"

然后再运行一次。这样，它实际上将执行重命名。