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用NA替换列值的排序
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Unix & Linux用户
提问于 2020-04-14 20:12:42
回答 1查看 26关注 0票数 1

我一直在尝试对这个文件进行排序,我一直在我的第一篇专栏中获得NAs,但我不知道为什么。

代码语言:javascript
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> head Coch_ATAC_peaks.bed
chr1    3181385 3181783
chr1    3389977 3390375
chr1    3456575 3456973
chr1    3661505 3661903
chr1    3903684 3904082
chr1    3916303 3916701
chr1    4316903 4317301
chr1    4322506 4322904
chr1    4402488 4402886
chr1    4416984 4417382

> sort -k 1,1V Coch_ATAC_peaks.bed | head
NA      1050187 1050585
NA      110317  110715
NA      127371  127769
NA      128207  128605
NA      13412   13810
NA      159542  159940
NA      193109  193507
NA      223382  223780
NA      233951  234349
NA      252365  252763

我最初是在Windows上创建这个文件的。我用dos2unix将它转换为UNIX。这些NAs是从哪里来的?

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回答 1

Unix & Linux用户

回答已采纳

发布于 2020-04-14 20:31:59

请看αғSнιηS的评论。我希望NAs是按顺序创建的,但它们始终存在于文件中。

代码语言:javascript
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> grep NA Coch_ATAC_peaks.bed
NA      2745    3143
NA      5650    6048
NA      9679    10077
NA      13412   13810
NA      39048   39446
NA      43021   43419
NA      55564   55962
NA      69578   69976
NA      110317  110715
NA      127371  127769

一旦NAs被移除,上游的> sort -k 1,1 Coch_ATAC_peaks.bed将按预期工作。

票数 0
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页面原文内容由Unix & Linux提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持
原文链接:

https://unix.stackexchange.com/questions/580085

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