基于另一个关联数组生成关联数组

Question

我创建了一个关联数组，如下所示。为了给出一些细节，键引用了特定的文件，因为我将在更大的脚本中使用这个数组(其中包含文件的目录将是getopts参数)。

declare -A BAMREADS
echo "BAMREADS array is initialized"

BAMREADS[../data/file1.bam]=33285268
BAMREADS[../data/file2.bam]=28777698
BAMREADS[../data/file3.bam]=22388955

echo ${BAMREADS[@]}  # Output: 22388955 33285268 28777698
echo ${!BAMREADS[@]} # Output: ../data/file1.bam ../data/file2.bam ../data/file3.bam

到目前为止，这个数组的行为似乎与我预期的一样。现在，我想在这个数组的基础上构建另一个关联数组。具体而言:我的第二个数组将具有与第一个数组相同的键，但我希望将值除以一个名为$MIN的变量。

我不知道以下哪一种策略是最好的，我似乎无法让这两种策略发挥作用。

Strategy 1：复制数组并修改数组？

MIN=33285268

declare -A BRAMFRACS
echo "BAMFRACS array is initialized"
BAMFRACS=("${BAMREADS[@]}")

echo ${BAMFRACS[@]}  # Output: 22388955 33285268 28777698
echo ${!BAMFRACS[@]} # Output: 0 1 2

这不是我想要的钥匙。即使它有效，我也需要对所有的值执行我提到的操作。

Stragegy 2：在遍历第一个数组时构建第二个数组。

MIN=33285268

declare -A BRAMFRACS
echo "BAMFRACS array is initialized"

for i in $(ls $BAMFILES/*bam)
do
    echo $i
    echo ${BAMREADS[$i]}
    BAMFRACS[$i] = ${BAMREADS[$i]} 
done

echo ${BAMFRACS[@]}
echo ${!BAMFRACS[@]}


#When I run this, I get the following error which I am unsure how to solve:

../data/file1.bam
33285268
script.bash: line 108: BAMFRACS[../data/file1.bam]: No such file or directory
../data/file2.bam
28777698
script.bash: line 108: BAMFRACS[../data/file2.bam]: No such file or directory
../data/file3.bam
22388955
script.bash: line 108: BAMFRACS[../data/file3.bam]: No such file or directory

谢谢

Answer 1

从旧数组构建新数组：

MIN=33285268

declare -A BRAMFRACS
for key in "${!BAMREADS[@]}"; do
    BRAMFRACS[$key]=$(( ${BAMREADS[$key]} / MIN ))
done

对您的代码的评论：

• 您的第一个建议代码无法工作，因为它将值从关联数组复制到新数组。这些值自动获得键0、1和2，但未复制原始键。如我前面所示，您需要按键复制数组键。通过这种方式，您可以将想要的值分配给正确的键。
• 第二个建议的代码包含一个语法错误，因为它在赋值中的=周围有空格。这就是你所看到的错误的来源。variable = value被解释为“使用操作数=和value执行的命令variable”。
• 如果希望迭代一组路径名，请不要使用ls。相反，只需执行for pathname in "$BAMFILES"/*bam; do。
• 引用变量展开。
• 考虑使用printf而不是echo输出变量数据。

相关信息：

• 为什么*不*解析ls？
• 什么时候需要双重报价？
• 忘记引用bash/POSIX外壳中的变量的安全性含义
• 为什么我的外壳脚本会被空格或其他特殊字符阻塞？
• 为什么打印比回声更好？

Answer 2

以回答有关复制关联数组的更一般问题。

当bash维护者在4.0中引入他们自己的关联数组时，他们做出了复制ksh93 API而不是zsh API的不幸决定。

ksh93/bash确实支持将关联数组设置为一个整体，但它使用的是：

hash=([k1]=v1 [k2]=v2)

语法。对于zsh，它是

hash=(k1 v1 k2 v2)

(为了兼容性，稍后还添加了对([k]=v...) ksh93语法的支持)。

但这意味着，使用ksh93和bash，从任意的键和值列表创建散列是非常困难的。

使用zsh语法，只需将列表作为交替键和值传递。例如，要复制两个关联数组：

h2=("${(@kv)h1}")

或来自有两列的CSV：

IFS=或来自键和值数组：h=("${(@)keys:^values}")使用ksh93/bash语法，虽然有"${!h[@]}"和"${h[@]}"扩展到键和值的列表(比如zsh中的"${(@k)h}"和"${(@v)h}" )，但是在h=(...)所期望的[key]=value语法( "${(@kv)h}"在d21中)中，没有操作符可以同时展开键和值。但是，在这些shell中复制关联数组(除了在循环中复制元素之外)的一个技巧是使用typeset -p的输出。例如，等效于zsh's h2=("${(@kv)h1}")将h1复制到h2中，可以在ksh93或bash中使用：h1_definition=$(typeset -p h1) &&
  eval "typeset -A h2=${h1_definition#*=}"使用bash，您可以将其缩短为：h1_definition=$(typeset -p h1) &&
  typeset -A h2="${h1_definition#*=}"(与ksh93类似，typeset -A h=value是bash中typeset -A h=([0]=value)的缩写，如果value以(开头，以)结尾，则内容被解释为复合关联赋值，就好像传递给eval (即使引用(或某些扩展的结果))。最后，使用循环也同样容易：for k in "${!h1[@]}"; do h2[$k]=${h1[$k]}; done\n,'; h=($(

或来自键和值数组：

A10

使用D11/D12语法，虽然有D13和D14扩展到键和值的列表(比如D17中的D15和D16 )，但是在D19所期望的D18语法( D20在d21中)中，没有操作符可以同时展开键和值。

但是，在这些shell中复制关联数组(除了在循环中复制元素之外)的一个技巧是使用D22的输出。

例如，等效于D23's D24将D25复制到D26中，可以在D27或D28中使用：

A29

使用D30，您可以将其缩短为：

A31

(与ksh93类似，D32是D34中D33的缩写，如果D35以D36开头，以D37结尾，则内容被解释为复合关联赋值，就好像传递给D38 (即使引用D39或某些扩展的结果))。

最后，使用循环也同样容易：

A40

Answer 3

这应该可以做到(还可以添加额外的键值)：

declare -A origDict=( [keya]=value_a [keyb]=value_b [keyc]=value_c )
declare -a newDict=( echo ${origDict[*]} [keynew]=new_value )