blocks|key|3782420|text|很难说出你想要建立什么样的物理/生物过程模型，所以我会给出一个更一般性的建议：|type|unstyled|depth|inlineStyleRanges|entityRanges|data|3782421|分子力学建模软件Wiki页面|unordered-list-item|offset|length|3782422|特别是，我要指出的是，LAMMPS适用于分布式系统，非常受欢迎。|entityMap|0|LINK|mutability|MUTABLE|url|https://en.wikipedia.org/wiki/Comparison_of_software_for_molecular_mechanics_modeling|1|https://en.wikipedia.org/wiki/LAMMPS^0|0|0|E|0|0|B|6|1^^$0|@$1|2|3|4|5|6|7|R|8|@]|9|@]|A|$]]|$1|B|3|C|5|D|7|S|8|@]|9|@$E|T|F|U|1|V]]|A|$]]|$1|G|3|H|5|6|7|W|8|@]|9|@$E|X|F|Y|1|Z]]|A|$]]]|I|$J|$5|K|L|M|A|$N|O]]|P|$5|K|L|M|A|$N|Q]]]]

It is a bit hard to say what particular physics/biological processes do you want to model, so I will give a more general recommendation:

<ul>
<li><a href="https://en.wikipedia.org/wiki/Comparison_of_software_for_molecular_mechanics_modeling" rel="nofollow noreferrer">Wiki page on software for molecular mechanics modeling</a></li>
</ul>

In particular, I would point you to <a href="https://en.wikipedia.org/wiki/LAMMPS" rel="nofollow noreferrer">LAMMPS</a> that is suited for distributed systems and is very popular.

In the long Wikipedia list of simulation <a href="https://en.wikipedia.org/wiki/List_of_computer_simulation_software" rel="nofollow noreferrer">environments</a> I find only a CFD simulation for cloud.

Which would you use for molecular biology simulations with cloud computing?

Criteria: it should be possible to reproduce the <a href="https://physicstoday.scitation.org/do/10.1063/PT.5.7117/full/" rel="nofollow noreferrer">polio virus simulation</a> from 2014.

Cloud native distributed molecular simulation environments?

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