可视化一个大图(10,000个节点)

Question

我目前正试图找到一种方法来可视化一个有10,000个节点和大约20,000个边的图形。我正在尝试这个javascript库，但很快就意识到这在计算上过于密集。有什么可行的选项来可视化一个有大约10,000个节点和多达100,000个边的图形？

如果没有允许计算工作的库，那么有哪些技术仍然可以让我获得宝贵的洞察力或表示图形，而不会对它的结构进行太多的更改？

Answer 1

伤寒也许能处理好。Graphistry绝对可以，但你可能需要支付。不过，最终，除非适合某些特定的图结构，否则大多数(如果不是全部的话)主要算法都会产生难以理解的混乱。

Answer 2

解决办法：

在R中，您可以使用以下命令获得学位分布

table(igraph::degree(my_graph, mode = "all")) # also try "in" and "out" 

您可能会得到以下输出：

   0     1    2     3     4     5 
8900 13510 6350  1130   250    20

按这样的顺序制作6个图: plot1显示5个或更多个边的节点，plot2显示4个边的节点，.，plot6显示所有没有边的节点。

使用上面table()命令的结果，这意味着在plot1中有20个节点，plot2将包含250个节点.

简单地省略那些包含太多节点的信息不足的情节。