基于登录号的Biopython搜索

Question

目前，我正在使用生物工程循环列表与登录号，以检索一些有关蛋白质的信息。我想检查一下等电点，氨基酸组成，理论pI，氨基酸数量和分子量。有些是我能找到的，但有些我不知道如何得到。希望有人能帮我。

请在下面找到我的代码摘要：

from bio import ExPASy, SwissProt

accession='P04264'
handle = ExPASy.get_sprot_raw(accession)
record = SwissProt.read(handle)

Sequence_length=record.sequence_length
Weight= record.seqinfo[1]

正如你所看到的，我知道如何得到序列的长度和重量，但我没有得到其他性质(等电点，氨基酸组成，理论pI)。有人知道如何利用生物技术获得这些价值吗？

提前谢谢。

Answer 1

对于你作为演示提供的蛋白质，似乎没有等电点信息。也许其他记录包含这一信息，但你必须搜索它。Bio.SwissProt.Record解码指令可以找到这里。您可以使用record.seqinfo获取序列长度和权重。用record.sequence可以找到蛋白质序列。你应该能够用蛋白质序列计算理论上的等电点。有在线工具将为您进行计算。