FactoExtra只提取前5个维度

Question

我试图使用来自FactoExtra的FactoExtra函数来提取对MCA中每个维度的单独贡献(来自FactoMiner包)，以便在进一步的分析中使用它。而不是获得所有维度的信息，以便我可以决定我需要多少(即使用scree plot或其他阈值)，我只得到前5维。

#this should get indiv data (coordinates, contributions, and cos2) from an MCA into a new variable called Reduced. 

new <- get_mca_ind(MCA)

#I want to look at it to make sure i've got what I need 

summary(new$contrib)

我得到了：

     Dim 1               Dim 2              Dim 3               Dim 4               Dim 5          
 Min.   :0.0000192   Min.   :0.000147   Min.   : 0.000009   Min.   : 0.000001   Min.   : 0.000001  
 1st Qu.:0.0482985   1st Qu.:0.057176   1st Qu.: 0.030022   1st Qu.: 0.029323   1st Qu.: 0.027998  
 Median :0.1935074   Median :0.245580   Median : 0.115066   Median : 0.116379   Median : 0.134186  
 Mean   :0.4081633   Mean   :0.408163   Mean   : 0.408163   Mean   : 0.408163   Mean   : 0.408163  
 3rd Qu.:0.6126128   3rd Qu.:0.562426   3rd Qu.: 0.325514   3rd Qu.: 0.366664   3rd Qu.: 0.433879  
 Max.   :3.0747167   Max.   :5.355167   Max.   :14.168752   Max.   :16.762048   Max.   :11.495243  

从new$contrib中，我希望得到一个矩阵，每个个体有一行，每个维度有一列- 68。相反，我得到了一个矩阵，每个个体有一行，前5个维度中的每一个都有一列。

注意：mca没有标记，所以我使用了pca -- FactoExtra也为pca提供了类似的函数。

Answer 1

您可以在mca调用中使用ncp =指定要在结果中保留的维度数(默认为5)。请参阅文档：https://cran.r-project.org/web/packages/FactoMineR/FactoMineR.pdf中的"MCA“。