Graphviz:如何使用带子图簇的超大图的neato？

Question

我有一个大的，但不是很大(？)图，有13个子图簇，包含约100个节点和3,147个边。

Windows上的点崩溃，Linux上的seg故障。

这个问题建议解决方案是使用neato，而不是dot。

但是，此页说

请注意这里有一些怪癖..。只有DOT和FDP布局方法似乎支持子图。

我的输出是一个巨大的，黑色的意大利面球，无论我放大多远。因此，我删除了所有的消息，除了一条，这表明子网格似乎是嵌套在彼此中的。

它们绝对不是嵌套在源文件中的；下面是一个示例，对商业敏感的名称进行了更改：

digraph G {
       labelloc="t";    // place the label at the top (b seems to be default)
       label="XXX message passing";
         rankdir = "LR"
         newrank = "true"

         subgraph cluster_AAA {
              label="AAA"
              rank="same"

            AAA_1
          }

         subgraph cluster_BBB {
              label="BBB"
              rank="same"

            BBB_1
            BBB_2
          }

         subgraph cluster_CCC {
              label="CCC"
              rank="same"

            CCC_1
            CCC_2
            CCC_3
          }

这似乎在语法上是正确的(后边跟在后面)。

因此，似乎链接的页面是正确的：

只有DOT和FDP布局方法似乎支持子图。

但是，看起来我也需要一个大图的新加藤。

我有什么选择？

我运行了fdp并得到了以下错误消息

错误:节点"xxx“包含在两个不可比较的集群"AAA”和"BBB“中。

这似乎提供了一个线索。是否真的在两个集群中不能使用节点名称？

如果是这样的话，解决方案似乎是在节点名称之前加上集群名称.

Answer 1

所以我没有一个通用的解决办法来解决你的问题。但你看过“火星”吗？这是一个命令行工具，专为使用具有非常大图形的graphviz程序而设计。你可以在这里找到它：https://github.com/marckhoury/mars