jpeg R包分期付款在非标准位置找不到jpeglib.h

Question

我试图将jpeg包安装在R中的一个Linux中(在这个服务器中我没有sudo访问权限)，并且jpeg安装没有找到我在本地安装的jpeglib.h。当configure.args='--with-libjpeg-include=/path失败时，我如何告诉R在哪里寻找它？

服务器操作系统版本是CentOS Linux 7(核心)

在R区我跑了：

>install.packages('jpeg', lib="/shared/mybossusr/R3.5.0/lib", repos="https://mirrors.nic.cz/R/", destdir="/shared/mybossusr/usr/tmp")

我得到了一个错误：

rjcommon.h:11:21:致命错误: jpeglib.h:没有这样的文件或目录#包括

所以我安装了jpeg-turbo

wget https://downloads.sourceforge.net/libjpeg-turbo/libjpeg-turbo-2.0.2.tar.gz
mkdir libjpeg-turbo-2
cd libjpeg-turbo-2
cmake -G"Unix Makefiles" -DCMAKE_INSTALL_PREFIX:PATH=/shared/mybossusr/bin/libjpeg-turbo-2 /shared/mybossusr/download/libjpeg-turbo-2.0.2
make
make install

我查过了，jpeglib.h在/shared/mybossusr/bin/libjpeg-turbo-2/include

我在我的~/.bashrc末尾添加了以下内容：

export CFLAGS="-I/usr/include -I=/shared/mybossusr/bin/libjpeg-turbo-2"

我登入和登录，在试图在R中安装jpeg时也遇到了同样的错误，我还将库的位置添加到了~/.barsh的路径中。

export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/shared/mybossusr/bin/libjpeg-turbo-2/include
export PATH=$PATH:/shared/mybossusr/bin/libjpeg-turbo-2/include

以防万一，因为我不完全明白什么时候软件会出现在哪里。source ~/.bashrc，登入和登录，但是什么都没有改变。

所以，我后来在R中尝试了一些我想出的论点：

install.packages('jpeg', lib="/shared/mybossusr/R3.5.0/lib", repos="https://mirrors.nic.cz/R/", destdir="/shared/mybossusr/R3.5.0/tmp", configure.args='--with-libjpeg-include=/shared/mybossuser/bin/jpeg/include') 

以及：

install.packages('jpeg', lib="/shared/mybossusr/R3.5.0/lib", repos="https://mirrors.nic.cz/R/", destdir="/shared/mybossusr/R3.5.0/tmp", configure.args='--with-libjpeg=/shared/mybossuser/bin/jpeg') 

或者：

install.packages('jpeg', lib="/shared/mybossusr/R3.5.0/lib", repos="https://mirrors.nic.cz/R/", destdir="/shared/mybossusr/R3.5.0/tmp", configure.args='--with-libjpeg-lib=/shared/mybossuser/bin/jpeg/include') 

试图告诉R libjpeg是在哪里安装的，但什么也没成功。

有什么configure.args能做到这一点吗？到目前为止，对于其他软件包来说，使用--with-package_name-lib是非常直接的，但我对此一无所知.

提前感谢！

Answer 1

尝试安装libjpeg-turbo-devel包。这就是我在RHEL 7上所做的。根据此页的说法，在CentOS 7上，包名是相同的。

Answer 2

对我来说，这就是其中的诀窍：

在非标准位置安装jpeg-turbo，比如$HOME/local，从：

https://github.com/libjpeg-turbo/libjpeg-turbo/releases

cmake -G"Unix Makefiles" -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=$HOME/local
make
make install

然后将这些全局指向.bashrc中的安装位置

export LIBRARY_PATH=$HOME/local/lib64:$HOME/local/lib:$LIBRARY_PATH
export LD_LIBRARY_PATH=$HOME/local/lib64:$HOME/local/lib:$LD_LIBRARY_PATH
export C_INCLUDE_PATH=$HOME/local/include:$C_INCLUDE_PATH

然后再尝试R包