我目前正在尝试修改FITS文件的头文件。更具体地说,我想给它添加新的关键字。我使用FitsIO for python,版本为0.9.11。
在一些数据处理过程中,我的程序创建了新的FITS文件,并更新了它们的内容和标题。我曾经和Astropy一起工作,但这不再是一种选择,所以我又回到了FitsIO,这对我来说是一个很大的挑战。
内容更新/覆盖是相当简单的,但是我在修改头文件时遇到了麻烦。为了隔离我的问题,并找到正确的过程(文档不是很有用),我创建了一个小程序,它只测试如何编写标头。
作为输入数据,我使用包含以下内容的FITSHDR对象:
update_data = fitsio.FITSHDR([
"IVAL = 36 / integer value ",
"SHORTS = 'hello w' ",
"DBL = 1.25 ",
"CDELT1 = 0.00333333333333 "])下面是经过测试的功能:
def write_hdu_1(data, fits_file):
with fitsio.FITS(fits_file, 'rw', clobber=True) as fits:
fits[extension].write_keys(data)结果:删除结束卡,破坏HDU。
def write_hdu_2(data, fits_file):
with fitsio.FITS(fits_file, 'rw', clobber=True) as fits:
for key in data.keys():
fits[extension].write_key(key, data.get(key))结果:删除结束卡,破坏HDU。
def write_hdu_3(fits_file):
with fitsio.FITS(fits_file, 'rw', clobber=True) as fits:
keydict = { 'name':'test', 'value':35, 'comment':'keydict test'}
fits[-1].write_key(**keydict)结果:
File "test_fitsio.py", line 26, in write_hdu_3
fits[-1].write_key(**keydict)
TypeError: write_key() got an unexpected keyword argument 'name'出于绝望,我终于手动添加了“结束”卡,就像这样:
def write_hdu(self, header_content):
self.fits[extension].write_keys(header_content)
self.fits[extension].write_key('END', '')但是,然后,结束卡用空格填充,我使用的其他库没有正确地识别这些空格。
那么,对于如何使用python FitsIO添加/更新头关键字,并且在此过程中不丢失“结束”卡,您有什么后知后觉吗?
谢谢!
发布于 2019-04-19 12:21:48
当您打开文件时,删除clobber选项,标题版本将工作。clobber选项用于在打开现有文件之前删除它,查看文档串和代码实现。
就我而言,这对于Python3中的Fitsio0.9.11来说是一种魅力:
with fitsio.FITS('test.fits', 'rw') as ff:
ff[-1].write_key('KEY', 'key value', 'my comment')另一方面,如果使用clobber选项,则使用现有文件上的相同代码在给定的HDU头中追加关键字,从磁盘中擦除该文件。
$ du -sh test.fits
308K test.fits
$ python3 -c "import fitsio; ff = fitsio.FITS('test.fits', 'rw', clobber=True); ff[-1].write_key('KEY', 'key value', 'my comment')"
$ du -sh test.fits
4.0K test.fits
$ cat test.fits
KEY = 'key value' / my comment END 这是一个quiete奇怪的结果,但是fitsio追加了END关键字,但是在一个空文件上,如果不是一个有效的FITS文件。
https://stackoverflow.com/questions/55748412
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