如何在jupyter笔记本中安装R-魔术？

Question

我在jupyter中创建了一个名为"rpy2“的新环境，并尝试使用%%R魔术，但是安装失败了。

如何在jupyter-笔记本中使用%R魔法？

平台: MacOS高塞拉

步骤

jupyter kernelspec list
conda create -n rpy2 python=3.7
source activate rpy2
which pip
/Users/poudel/miniconda3/envs/rpy2/bin/pip install rpy2
conda install ipykernel
python -m ipykernel install --user --name rpy2 --display-name "Py37rpy2"
jupyter-notebook

发行

# Now 
import rpy2 shows no error
import rpy2.rinterface  # gives error

Note

# I have checked all the files given in error log, all of them exist
  492  ls /Users/poudel/miniconda3/lib/R/lib/libR.dylib
  493  ls /usr/lib/libiconv.2.dylib
  494  ls /Users/poudel/miniconda3/lib/R/lib/libR.dylib
  495  /Users/poudel/miniconda3/lib/R/lib/libR.dylib
  496  ls /Users/poudel/miniconda3/lib/R/lib/libR.dylib

All shows given file, and none is missing.

误差

无法加载库'/Users/poudel/miniconda3/lib/R/lib/libR.dylib'：dlopen(/Users/poudel/miniconda3/lib/R/lib/libR.dylib，2)：符号未找到：_libiconv引用自:/usr/poudel/miniconda3 3/lib/r/lib/libR.dylib，预期在:/usr/lib/libionv.2.dylib/usr/poudel/miniconda3/lib/R/lib/libR.dylib中预期为:/usr/lib/libionv.2.dylib/usr/poudel/miniconda3/lib/R/libR.dylib。

正如@akrun所建议的那样，更新，我尝试使用pyper，但是加载一个libary需要花费无限的时间，当停止时显示它已经断了管道。

pip install pyper。

​

​

Answer 1

如果你还在寻找解决方案，这就是你所需要的。

从笔记本开始

%load_ext rpy2.ipython

然后使用R魔术函数运行R单元

%R 图书馆(“tidyverse”)

这适用于最新的rpy2版本(3.4.5)。