重复rstan::stan()通过并行计算

Question

我试着验证模型。我复制了rstan::stan()的估计。

每一次拟合都是不相关的，因此在原则上，可能是可以并行计算的。

是否有这样的软件包来并行计算独立的多个数据集的rstan::stan()。

Answer 1

不是的。

对这个答案进行扩展，您可以使用R的并行处理工具来设置许多呼叫。如果希望对每个模型使用相同的模型，请使用stan_model()编译Stan程序，然后将对stan()的调用替换为对sampling()的调用。这样可以避免重新编译。我们通常建议使用CmdStan进行大规模计算，因为它没有R的内存开销，而且I/O、系统崩溃等方面的错误也较少，这样您就可以轻松地在多台计算机上扩展。

另外，如果您按照使用library(rstan)时得到的指示运行，那么每个链都将并行运行。