用PIL TiffTags从.tif图像元数据中提取缩放条

Question

我是Python新手，我希望从电子显微镜(.tif)图像中提取比例信息。

当我在记事本中打开文件并滚动到底部时，我会看到标题“扫描”和下面的"PixelWidth=3.10059e-010“。

我想用Python读取这个值，并使用它作为测量图像中物理距离的校准因子。

我发现了一种使用PIL (https://stackoverflow.com/a/46910779/10244370)的很有前途的方法，但是在运行推荐代码时遇到了一个错误。

from PIL import Image
from PIL.TiffTags import TAGS

with Image.open(imagetoanalyze) as img:
    meta_dict = {TAGS[key] : img.tag[key] for key in img.tag.iterkeys()}

我预期这将创建一个对象"meta_dict“，其中包含"PixelWidth”这样的字符串，并像"3.10059e-010“那样浮动。

相反，我看到：

Traceback (most recent call last):

  File "<ipython-input-62-4ea0187b2b49>", line 2, in <module>
    meta_dict = {TAGS[key] : img.tag[key] for key in img.tag.iterkeys()}

  File "<ipython-input-62-4ea0187b2b49>", line 2, in <dictcomp>
    meta_dict = {TAGS[key] : img.tag[key] for key in img.tag.iterkeys()}

KeyError: 34682

很明显我做错了什么。任何帮助都将不胜感激。谢谢!

Answer 1

看起来您的文件可能是file，它在TIFF标记34682中包含类似于INI的元数据。

尝试使用蒂夫文件

import tifffile
with tifffile.TiffFile('FEI_SEM.tif') as tif:
    print(tif.fei_metadata['Scan']['PixelWidth'])

Answer 2

使用PIL，我认为使用for循环来设置字典，然后打印所需的结果会更清楚。

from PIL import Image
from PIL.TiffTags import TAGS


with Image.open(imagetoanalyze) as img:
    meta_dict = {}
    for key in img.tag:      # don't really need iterkeys in this context
        meta_dict[TAGS.get(key,'missing')] = img.tag[key]

# Now you can print your desired unit:

print meta_dict["PixelWidth"]

如果只需要一个值，还可以使用以下内容查找PixelWidth标记的编号：

for k in img.tag:
     print k,TAGS.get(k,'missing')

然后，只需打印img.tag[<thatnumber>]而不填充字典。