网络环境的动态变化

Question

是否可以通过网络动态地改变conda环境？

use_condaenv(condaenv='env1', conda='/path/to/conda')
package1 = import('pack1')
package1$do_smth

use_condaenv(condaenv='env2', conda='/path/to/conda')
package2 = import('pack2')
package2$do_smth2

目前，我在这里得到一个导入错误：

package2 = import('pack2')

ModuleNotFoundError:没有名为pack2的模块

Answer 1

您正面临这个问题，因为reticulate可以而不是在单个R会话中更改python解释器。您可以使用ModuleNotFoundError: No module named pack2，因为reticulate仍然在使用没有pack2的env1。试一试：

use_condaenv(condaenv='env1', conda='/path/to/conda')
use_condaenv(condaenv='env2', conda='/path/to/conda', required = TRUE) # should throw an error

作为解决办法，您可以做的是使用callr包来运行python代码，就好像它将在独立的R会话中运行一样：

library(callr)

# change variables accordindly:
venv <- "env2" # env1 or env2

# (optional) a python script containing a function which you would like to run from R
python_script_path <- "some_python_script.py"
# (optional)
some_other_parameter <- "foobar"

result <- r(function(venv, python_script_path, some_other_parameter){
    library(reticulate)
    use_condaenv(venv, conda='/path/to/conda', required = T)

    # try to import package
    package = import('pack2') # pack1 or pack2
    return(package$do_smth())

    # (oprional) or even to source a python script
    # source_python(python_script_path)
    # run a python function which is sourced from `python_script_path`
    # result <- run_calculations(some_other_parameter)
    # return(result)
  }, args = list(venv, python_script_path, some_other_parameter))

您应该能够在单个会话中运行用于env1和env2与pack2的代码，而不会出现任何问题。

注意:匿名函数将拥有自己的环境，为了从全局环境访问变量，需要将它们作为参数传递给函数(虽然您可能可以传递全局环境本身，但我没有尝试)。