表和HDF5 python包的问题

Question

这是我的代码：

import os
import pandas as pd


def load_hdf(filename):
    """
    Load the first key of an HDF file
    """
    hdf = pd.HDFStore(filename,mode = 'r')
    keys = hdf.keys()
    if not keys:
        hdf.close()
        return pd.DataFrame()
    data_df = hdf.get(keys[0])
    hdf.close()
    return data_df

当我这么做的时候

load_hdf(os.path.join(PATH, 'crm.hd5'))

我有一个错误：

HDFStore requires PyTables, "No module named 'tables'" problem importing

当我尝试：

pip install tables

我有一个错误：

Using Python 3.7.0 (v3.7.0:1bf9cc5093, Jun 26 2018, 23:26:24)
    * USE_PKGCONFIG: False
    .. ERROR:: Could not find a local HDF5 installation.
       You may need to explicitly state where your local HDF5 headers and library can be found by setting the ``HDF5_DIR`` environment variable or by using the ``--hdf5`` command-line option.

...

Command "python setup.py egg_info" failed with error code 1 in /private/var/folders/2s/sn3gzfwd6_37v0ggqd0n8qy00000gn/T/pip-install-1mx6wjd3/tables/

我已经有了hdf5在我的Anaconda中。我有Python 3.7。

Answer 1

我还安装了pytable，无法找到解决方案。对我起作用的是安装HDF5 2.8.0rc1的发布候选版本(如here所示)。似乎熊猫安装的HDF5版本不完全兼容。所以试着：

pip install h5py==2.8.0rc1

希望能帮上忙。