R3.4.4的码头文件，如何缩短建坞时间，至少需要30分钟

Question

为了缩小我的码头形象的R，早些时候它是2G。我已经写了安装和所有的过程和删除包在一个层，这有助于减少图像大小。但在30分钟至45分钟之间，至少需要30分钟才能建立起码头图像。如何缩短时间

Dockerfile

FROM centos
LABEL maintainer="admin.squad@xyz.com" \
  version="2.0" \
  project="xyz-R"
#EXPOSE 9988
ARG APP_HOME="/opt/deployment"
ARG PROJECT_NAME="xyz-R"
ENV LANG en_US.UTF-8
ENV APP_HOME=${APP_HOME} \
PROJECT_NAME=${PROJECT_NAME} \
PROJECT_HOME=${APP_HOME}/${PROJECT_NAME}

#RUN yum makecache
RUN yum install -y wget centos-release-scl bzip2-devel openssl- 
devel cyrus-sasl-devel libxml2-devel && \
yum install -y devtoolset-6 && \
source scl_source enable devtoolset-6 && \
export PATH=/opt/rh/devtoolset-6/root/bin:$PATH && \
rm -rf /var/cache/yum && \
mkdir packages1; cd packages1; wget -qO- https://downloads.sourceforge.net/project/libpng/zlib/1.2.8/zlib-1.2.8.tar.gz | tar zvx && \
cd zlib-1.2.8; ./configure; make; make install; cd .. && \
pwd && \
wget -qO- http://downloads.sourceforge.net/pcre/pcre-8.35.tar.gz | tar xzv && \
cd pcre-8.35; pwd; ./configure; make; make install; cd .. && \
wget -qO- http://tukaani.org/xz/xz-5.2.2.tar.gz | tar xzv && \
cd xz-5.2.2; ./configure; make; make install; cd .. && \
wget -qO- https://curl.haxx.se/download/curl-7.47.1.tar.gz | tar xzv && \
cd curl-7.47.1; ./configure; make; make install; cd .. && \
wget -qO- https://cran.r-project.org/src/base/R-3/R-3.4.4.tar.gz | tar xzv && \
cd R-3.4.4; ./configure --with-readline=no --with-x=no && \
make; make install;cd .. && \
cd zlib-1.2.8; pwd; make uninstall; cd ..; rm -r /packages1/zlib-1.2.8 && \
pwd; cd pcre-8.35; pwd; make uninstall; cd ..;rm -r /packages1/pcre-8.35   && \
cd xz-5.2.2; pwd; make uninstall; cd ..; rm -r /packages1/xz-5.2.2; cd curl-7.47.1; pwd; make uninstall; cd ..; rm -r /packages1/curl-7.47$
Rscript -e 'install.packages("dplyr", repos="https://cloud.r-project.org/", dependencies=TRUE)' && \
#   Rscript -e 'remove.packages("dplyr", lib=/usr/local/lib64/R/library)' && \
Rscript -e 'install.packages("xml2", repos="https://cloud.r-project.org/")' && \
#    Rscript -e 'remove.packages("xml2", lib=/usr/local/lib64/R/library)' && \
Rscript -e 'install.packages("mongolite", repos="https://cloud.r-project.org/")' && \
#    Rscript -e 'remove.packages("mongolite", lib=/usr/local/lib64/R/library)' && \
Rscript -e 'install.packages("tidyr", repos="https://cloud.r-project.org/")' && \
#    Rscript -e 'remove.packages("tidyr", lib=/usr/local/lib64/R/library))' && \
Rscript -e 'install.packages("Rcpp", repos="https://cloud.r-project.org/")' && \
#    Rscript -e 'remove.packages("Rcpp", lib=/usr/local/lib64/R/library))' && \
Rscript -e 'install.packages("RcppEigen", repos="https://cloud.r-project.org/")' && \
#    Rscript -e 'remove.packages("RcppEigen", lib=/usr/local/lib64/R/library))' && \
Rscript -e 'install.packages("rstan", repos="https://cloud.r-project.org/")' && \
#    Rscript -e 'remove.packages("rstan", lib=/usr/local/lib64/R/library))' && \
Rscript -e 'install.packages("prophet", repos="https://cloud.r-project.org/")' && \
#    Rscript -e 'remove.packages("prophet", lib=/usr/local/lib64/R/library))' && \
Rscript -e 'install.packages("rjson", repos="https://cloud.r-project.org/")'  && \
#    Rscript -e 'remove.packages("rjson", lib=/usr/local/lib64/R/library))' && \
Rscript -e 'install.packages("stringi", repos="https://cloud.r-project.org/")' && \
#    Rscript -e 'remove.packages("stringi", lib=/usr/local/lib64/R/library))' && \
Rscript -e 'install.packages("stringr", repos="https://cloud.r-project.org/")' && \
yum remove -y devtoolset-6  && \
rm -rf /var/cache/yum && \
rm -rf /usr/local/lib64/R/library
RUN rm -rf /tmp

Answer 1

这里有一些可能对你有帮助的想法：

最快的安装可能是Ubuntu18.04与c4d2u PPA一起作为基础。这样你就可以安装大部分(全部？)R包作为二进制文件，而不是从源安装它们。IIRC甚至还有一个来自rocker项目的Docker映像来实现这个想法。另一种可能是基于Debian的rocker/r-ver:3.4.4。

如果必须是CentOS，您应该启用EPEL。这样就可以直接获得R 3.4.4。但是，R的所有构建依赖项都可以作为二进制文件使用，包括开发包和运行时包之间的分离。如果您从源构建R，则应该使用一个RUN块

• 安装运行时和开发依赖项。
• 下载、配置和安装R
• 删除R源和开发包

对于包安装，我将使用一个带有适当选项的install.packages (sp?)以启用并行处理。注意，最后的rm -rf /tmp/*应该是同一个RUN语句的一部分。

我将使用两个RUN语句，一个用于安装R，另一个用于安装软件包。这不应增加图像大小(显着地)。但是，如果只更改包列表，则不必重新安装R。