SimpleITK读取io.ByteIO

Question

我有一个代表上传图片(.nii)的io.ByteIO对象，有没有办法从它获取simpleITK对象？一种糟糕的解决方法是先写入文件，然后使用simpleITK读取它

Answer 1

不幸的是，SimpleITK的Image IO不能在流上工作。它将只从文件中读取。

看起来你可以使用nibabel从你的流中读取图像。然后将其转换为numpy数组，然后将numpy转换为SimpleITK。它很难看，但至少你不会回到磁盘上。

这里有一篇关于阅读nibabel中的流的帖子：https://mail.python.org/pipermail/neuroimaging/2017-February/001345.html

以下是如何从nibabel到numpy的方法：How to convert Nifti file to Numpy array?

然后使用SimpleITK数组，调用SimpleITK.GetImageFromArray来创建numpy映像。

这些步骤不会保留任何图像元信息，因此您必须复制所有内容，如图像间距、原点和方向。