R ncdf4不能从netcdf读取字符变量。

Question

我试图从包含字符的netcdf文件中读取变量。

library(ncdf4)

NCFile <- nc_open('MD02_2575.age')
ncvar_get(NCFile, 'Label')

我希望

'KIA33119' 'KIA24904' 'KIA33120' 'KIA24905' 'KIA33121' 'KIA24906' 'KIA25875' 'KIA24907' 'KIA24903' 'User    ' 'User    ' 'User    ' 'User    ' 'User    '

根据我用Matlab读取文件时得到的结果，而用R得到

[1] "KKKKKKKKKUUUUU" "IIIIIIIIIsssss" "AAAAAAAAAeeeee" "323232222rrrrr" "343434544     " "191919899     " "102020700     " "940516573     "

我想使用R，这看起来像是编码问题，有人建议如何读取变量吗？

Answer 1

Label是一个带有字符的二维数组；

char Label(Label_Characters, Length);

此外，ncdump在将其转换为字符串列表时遇到了困难，例如：ncdump -v Label MD02_2575.age也给出了“不正确”的结果：

 Label =
  "KKKKKKKKKUUUUU",
  "IIIIIIIIIsssss",
  "AAAAAAAAAeeeee",
  "323232222rrrrr",
  "343434544     ",
  "191919899     ",
  "102020700     ",
  "940516573     " ;

我写了“不正确”，因为从NetCDF文件本身来看，不清楚(1)单个字符是否需要连接到字符串，(2)如果是这样的话，那么应该沿着哪个维度执行连接。老实说，我很惊讶ncdump，R和Matlab会这样做吗？

为了说明这个问题(使用Python)：

import netCDF4 as nc4

f = nc4.Dataset('MD02_2575.age')
v = f.variables['Label'][:,:]

label1 = v[:,0].tostring()  # Correct
label2 = v[0,:].tostring()  # Same as `ncdump`, `R`, ..

print(label1, label2)

结果：'KIA33119' 'KKKKKKKKKUUUUU'