无法遍历SimpleITK中的图像

Question

我想在不同的文件夹中阅读图片。我写了以下代码

     for Case_id in range(1,6):

     path ='/Users/XXXXXX/Desktop/pyradiomics/Converted/Case{}/'.format(Case_id)
     print(path)
     for files in os.listdir(path):
       if files.endswith("Image.nii"):
          print(files)
          image=sitk.ReadImage (files)
       if files.endswith("label.nii"):
          print(files)
          mask=sitk.ReadImage (files)

当我运行这个程序时，我会收到一条错误消息：

/scratch/dashboard/SimpleITK-OSX10.6-x86_64-pkg/SimpleITK/Code/IO/src/sitkImageReaderBase.cxx:89：：RuntimeError: SimpleITK ReadImage： 错误:文件"xxxx_image.nii“不存在。

如果只运行print命令，就可以看到指定文件夹中的所有文件和路径。会很感激你的帮助。

Answer 1

@戴夫-陈是对的。您需要加入路径才能获得完整的路径。尝试：

 for Case_id in range(1,6):

 path ='/Users/XXXXXX/Desktop/pyradiomics/Converted/Case{}/'.format(Case_id)
 print(path)
 for files in os.listdir(path):
   if files.endswith("Image.nii"):
      print(files)
      image=sitk.ReadImage(os.path.join(path, files))
   if files.endswith("label.nii"):
      print(files)
      mask=sitk.ReadImage(os.path.join(path, files))

Answer 2

我猜您需要将完整的路径名传递给ReadImage。“文件”只是文件的名称。如果没有在“路径”目录中运行脚本，ReadImage将不会对文件进行清理，因此它将在当前工作目录中查找。