GASNET基板的多区域配置问题

Question

我在Chapel有一个带有分布式迭代器的forall代码，我试图在集群上运行它。

当使用UDP管道时，代码运行得很好。

现在，我正在尝试使用便携式MPI作为内部层，但没有成功。

这是我的配置：

export CHPL_TASKS=qthreads

export CHPL_COMM=gasnet

export CHPL_COMM_SUBSTRATE=mpi

export CHPL_LAUNCHER=gasnetrun_mpi

仅使用此配置，只使用一个节点。看一下Gasnet文档，我补充道：

export GASNET_NODEFILE="$(pwd)"/nodes

export MPIRUN_CMD='mpirun -np %N -machinefile %H %C'

(正式文件中缺少这些细节)。

好的，现在我可以使用MPI运行教堂代码了。但是：

( 1)每个节点有32个核。如果将hello6 -nl x设置为x< 33，则所有进程都由第一个区域设置执行。

1.1)我想运行hello6 -nl 4，所以每个节点都会从locale和adress x.address上打个招呼。

( 2)看起来，教堂堂使用$OAR_NODEFILE (可能是另一个)来创建区域设置向量，因为这个OAR_NODEFILE每个节点每个核心都有一个条目。

3)然而，即使我手动更改了$GASNET_NODEFILE和$OAR_NODEFILE，每个节点的区域设置向量仍然包含每个核的一个条目。

4)在集群中，我可以访问，我运行的mpi代码如下：mpirun -machinefile $OAR_NODEFILE ~/program。但是，GASNET需要导出最后一个变量的语法。

有人能帮我配置运行时，以便在多个地区上执行我的代码吗？

诚挚的问候,

蒂亚戈·卡内罗。

Answer 1

假设您使用的是Chapel 1.18版本和Open (如果不是这样的话，请告诉我。)在Chapel 1.18和更早版本中有一个bug，当使用Open时，所有教堂实例都首先打包到一个节点上。这已经固定在主版(https://github.com/chapel-lang/chapel/pull/11546)上，修复将包含在1.19版本中。

您可以尝试使用git，也可以将MPIRUN_CMD="mpirun --bind-to none --map-by ppr:1:node -np %N %P %A"设置为解决方案。