在RStudio中使用行名和列名中的文本创建表

Question

我希望创建一个表格来比较4种不同的基因集，看看不同的基因集之间是否有重叠。我谨将它们称为：

'BCG_validation‘ 'BCG_discovery‘ 'MTB_validation‘ 'MTB_discovery‘

到目前为止，我编写的代码如下：

mx.overlap <- matrix(rep(NA,16), ncol=4)
mx.overlap

colnames(mx.overlap) <- paste('BCG_validation', 'BCG_discovery',
'MTB_validation','MTB_discovery')

rownames(mx.overlap) <- paste('BCG_validation', 'BCG_discovery',       
'MTB_validation', 'MTB_discovery')

但是，当我执行它时，我收到了错误消息：

酒窝名称(X) <- dn中的错误： 2的长度不等于数组范围。

关于如何修改此代码以成功创建表的任何想法吗？

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在您可以看到的地方,1一直到4，这就是我希望看到的标题，以便当我输入'View‘时，我可以直观地看到所有的行名和列名。

Answer 1

错误使用?paste，使用?c

mx.overlap <- matrix(rep(NA,16), ncol=4)

colnames(mx.overlap) <- c('BCG_validation', 'BCG_discovery',
                              'MTB_validation','MTB_discovery')

rownames(mx.overlap) <- c('BCG_validation', 'BCG_discovery',       
                              'MTB_validation', 'MTB_discovery')

mx.overlap

还可以在矩阵定义之后使用?dimnames：

nm <- c('BCG_validation', 'BCG_discovery',
        'MTB_validation','MTB_discovery')

dimnames(mx.overlap) <- list(nm, nm)

或者更直接地在矩阵中使用dimnames =参数：

nm <- c('BCG_validation', 'BCG_discovery', 'MTB_validation', 'MTB_discovery')
mx.overlap <- matrix(rep(NA,16), ncol=4, dimnames = list(nm, nm))