使用Python从OpenDAP批量下载数据

Question

我正在尝试从.nc下载多个OpenDAP文件。当我手动下载文件时(没有脚本)，这些文件就会像预期的那样工作。为了加快处理速度，我有一个脚本，可以批量下载数据。但是，当我使用xarray下载数据时，文件要大10倍，文件似乎已经损坏。

我的剧本是这样的：

import pandas as pd
import xarray as xr
import os
import numpy as np

dates = pd.date_range(start='2016-01-01',end='2016-01-05',freq='D')
my_url = "http://www.ifremer.fr/opendap/cerdap1/ghrsst/l4/saf/odyssea-nrt/data/"

print("  ")
print("Downloading data from OPeNDAP - sit back, relax, this will take a while...")
print("...")
print("...")

# Create a list of url's 
data_url = []
cnt = 0
for i in np.arange(1,5):
    ii = i+1

    data_url.append(my_url + str(dates[cnt].year)+"/"+ str('%03d'%+ii)+"/"\
        +str(dates[cnt+1].year)+str('%02d'%dates[cnt+1].month)+str('%02d'%dates[cnt+1].day)\
        +"-IFR-L4_GHRSST-SSTfnd-ODYSSEA-SAF_002-v2.0-fv1.0.nc?time[0:1:0],lat[0:1:1749],lon[0:1:2249],analysed_sst[0:1:0][0:1:1749][0:1:2249],analysis_error[0:1:0][0:1:1749][0:1:2249],mask[0:1:0][0:1:1749][0:1:2249],sea_ice_fraction[0:1:0][0:1:1749][0:1:2249]")

    cnt = cnt+1

url_list = data_url

# Download data from the url's
count = 0
for data in url_list:
    print('Downloading file:', str(count))
    ds = xr.open_dataset(data,autoclose=True)
    fname = 'SAFodyssea_sst'+str(dates[count+1].year)+str('%02d'%dates[count+1].month)+str('%02d'%dates[count+1].day)+'.nc'
    ds.to_netcdf(fname)
    count = count +1
    del ds, fname

print('DONE !!!')

我有0.10.8版的xarray。我尝试使用python2.7和python 3.5.6以及在windows 10和Ubuntu 16.04上运行这个程序，并得到了相同的结果。

非常感谢你的帮助。

Answer 1

这些文件中的每一个都作为netCDF文件的关联URL，例如，002-v2.0-fv1.0.nc

解决这个问题的一个简单方法是使用一个库(如请求)来下载每个文件，例如，如下所述：How to download large file in python with requests.py?