在Python中有两个以上的组时，如何进行精确的Fisher测试？

Question

我的数据如下：

prfs
ex  F   M
Pref        
C   11  20
B   15  6
A   3   5

我想做一个精确的费舍尔测试。在2x2中有一个函数，但只接受2x2应急表：

stats.fisher_exact(prfs, alternative = 'two-sided')
ValueError: The input `table` must be of shape (2, 2).

在R中，有一个函数可以做到这一点，但是在Python中呢？在R：

fisher.test(prfs)
Fisher's Exact Test for Count Data

data:  prfs
p-value = 0.03261
alternative hypothesis: two.sided

Answer 1

scipy.stats.chi2_contingency()是您将得到的最接近的。