我在RedHatEnterpriseLinux6上使用R3.4.1,我在/tools/bioinfo/app/R-3.4.1/lib64/R/library下安装了3.0版的软件包/tools/bioinfo/app/R-3.4.1/lib64/R/library。
> library(asreml)
Loading required package: lattice
Checking for license <redacted>
> .libPaths()
[1] "/tools/bioinfo/app/R-3.4.1/lib64/R/library"这个软件包的第4版现在已经发布了,但是我们希望将第3版和第4版的结果进行比较,为此,我们希望在我们的系统上安装version4作为asreml4。我已经下载了最新版本的*tar.gz文件,但是如果我下载了
R CMD INSTALL asreml_4.1.0.93.tar.gz它在asreml文件夹中安装它,覆盖旧版本。这不是我想要的。
我还尝试在另一个地方安装它,将文件夹重命名为asreml4,并将该文件夹复制到/tools/bioinfo/app/R-3.4.1/lib64/R/library,然后尝试加载它,但随后它加载了错误的版本:
> library(asreml, lib.loc="/tools/bioinfo/app/R-3.4.1/lib64/R/library/asreml4")
> packageVersion("asreml")
[1] ‘3.0.1’因此,如何将其安装在asreml4文件夹中,以便能够使用library(asreml4)调用它
发布于 2018-09-21 16:09:57
1)编辑描述下载源代码,编辑描述文件以具有不同的名称,然后构建和安装它。
2)单独的库交替地将新版本安装到单独的库中,然后使用其中之一获得所需的版本:
library(asreml, lib = ...)
library(asreml)( 2a) .libPaths变体是使用.libPaths(new)更改默认的库路径
library(asreml)然后把它改回来。
2b) dev_mode实现库切换的一种简单方法是使用没有参数的dev_mode() (来自devtools包)。发出第一个dev_mode()命令后,默认库变成~/R。此时,使用普通的install.packages命令安装新版本的asrmel,而不指定lib=,它将被安装到~/R中。在没有指定库的情况下使用library加载它将导致它首先查看~/R。然后测试它,最后,当您准备切换回原始库和原始的asreml时,再次发出dev_mode()。dev_mode()操作默认库路径,因此您可以在任何时候使用不带参数的.libPaths()来检查当前默认值是什么。
library(devtools)
dev_mode() # ~/R-dev now default library
# ...
dev_mode() # restore usual default libraryhttps://stackoverflow.com/questions/52447227
复制相似问题