在biomod2中运行Maxent时文件未找到错误

Question

当我将Maxent运行到biomod2中时，我得到了以下错误：

Error in file(file, "rt") : cannot open the connection

此外:警告信息：

1: running command 'java' had status 1 
2: In file(file, "rt") :
  cannot open file 'Sargassum.muticum.42.1.25.30/models/sstrange_sstmax_parmean_salinity/Sargassum.muticum.42.1.25.30_AllData_RUN1_MAXENT.Phillips_outputs/Sargassum.muticum.42.1.25.30_AllData_RUN1_Pred_swd.csv': No such file or directory

我遵循了directions.pdf添加java路径的步骤，maxent.jar目录被复制到工作目录中，路径中没有空格。

当我打字时

file.exists("maxent.jar")

我得到了真正的价值。

以下是我的选择：

model <- biomod2::BIOMOD_Modeling(formatdata                                   ,models=c("GLM","MAXENT.Phillips","RF","SRE")                                      ,models.eval.meth=c('KAPPA', 'TSS', 'ROC')                                      ,models.options = biomod_options('C:/Users/me/maxent.jar')                                      ,SaveObj = TRUE,do.full.models = FALSE                                      ,NbRunEval=1,DataSplitTable=dataSplitTable                                    ,VarImport=3,modeling.id = gsub("BO_", "", paste0(layers, collapse= "_")))

Answer 1

我有同样的问题，这里提出的解决方案解决了我的问题：Error running maxent from within biomod2 in R

简而言之，您到maxent.jar的路径不应该包含任何空格。