ROracle封装安装失败

Question

我知道有关这个问题的其他问题，但它们与我的系统设置或安装错误没有太多共同之处，所以：

我使用的是Windows 7，64位

我已经安装了64位Oracle客户端18.3.0.0.0及其sdk和odbc扩展，可从http://www.oracle.com/technetwork/topics/winx64soft-089540.html获得

我已经将安装位置`C:\Oracle\instantclient_18_3‘放在了路径上。

我已经安装了R3.5.1和Rtools 3.5；两者都在路径上。

在R，

Sys.setenv(
  'ORACLE_HOME' = 'C:/Oracle/instantclient_18_3',
  'OCI_INC'     = 'C:/Oracle/instantclient_18_3/sdk/include',
  'OCI_LIB64'   = 'C:/Oracle/instantclient_18_3'
  )
install.packages("ROracle", type="source")

结果如下：

* installing *source* package 'ROracle' ...
** package 'ROracle' successfully unpacked and MD5 sums checked
Oracle Client Shared Library 64-bit - 18.3.0.0.0 Operating in Instant Client mode.
found Oracle Client C:/Oracle/instantclient_18_3
found Oracle Client include C:/Oracle/instantclient_18_3/sdk/include
copying from C:/Oracle/instantclient_18_3/sdk/include
** libs
c:/Rtools/mingw_64/bin/gcc  -I"C:/Program Files/R/R-3.5.1/include" -DNDEBUG -I./oci         -O2 -Wall  -std=gnu99 -mtune=generic -c rodbi.c -o rodbi.o
In file included from rooci.h:75:0,
                 from rodbi.c:181:
./oci/oci.h:716:20: fatal error: ociver.h: No such file or directory
 #include <ociver.h>
                    ^
compilation terminated.
make: *** [C:/Program Files/R/R-3.5.1/etc/x64/Makeconf:208: rodbi.o] Error 1
ERROR: compilation failed for package 'ROracle'
* removing 'C:/Users/obrienle/Documents/R/win-library/3.5/ROracle'
In R CMD INSTALL
Warning in install.packages :
  installation of package ‘ROracle’ had non-zero exit status

Rtools无法定位的文件ociver.h绝对存在于OCI_INC文件夹中，因此我不知道为什么会发生这种情况。有人知道该怎么做吗？

Answer 1

我也有同样的问题：

c:/Rtools/mingw_64/bin/gcc  -I"C:/PROGRA~1/R/R-35~1.1/include" -DNDEBUG -I./oci         -O2 -Wall  -std=gnu99 -mtune=generic -c rodbi.c -o rodbi.o
In file included from rooci.h:75:0,
                 from rodbi.c:181:
./oci/oci.h:716:20: fatal error: ociver.h: No such file or directory
 #include <ociver.h>
                    ^
compilation terminated.

一旦我看得离错误更近一些，我就意识到发生了什么。在我看来，Rtools的参数是将-I设置为R的包含文件夹，而不是OCI的包含文件夹，猜猜R的包含文件夹中没有什么？没错，奥西弗。我相信R试图将OCI包含文件夹的内容复制到R文件夹中，因为这一行是错误的几行：

copying from C:\Oracle\instantclient_18_3\sdk\include\

如果运行失败，作为管理员可能会有所帮助吗？或者编辑文件夹权限？

无论如何，我手动将oracle包含文件夹的内容复制到R文件夹，这似乎解决了我的问题。

Answer 2

感谢埃里克的回答，它绝对有效！但问题似乎在于包本身，而不是R试图将包含文件复制到R的包含文件夹中。所以另一个解决办法是

• 解压缩源存档，以便在当前目录中有一个ROracle文件夹
• 编辑文件ROracle/configure.win并将下面一行添加到文件的末尾 cp ${ROCI_INC}/ociver.h ./src/oci
• 保存并关闭文件。现在，在当前目录中，在更新的包文件夹上运行install命令。 R CMD INSTALL ROracle

这应该能解决问题。我不确定开发人员是否忘了在configure.win中包括这一行，或者这仅仅发生在更新版本的R中，因为这个包自2016年以来就没有更新过，而且在文档中他们提到ROracle支持多达3.2个的R版本。

Answer 3

我用4.02。我发现最新的甲骨文网站上的ROracle软件包适用于InstantClient和上面描述的Sys.setenv设置。

谢谢你跟踪我。