CoxPHFitter:输入必须至少有3个条目

Question

我试图运行lifelines‘CoxPHFitter (python3)，并得到以下值错误：

输入必须至少有3个条目！

我已经阅读了它连接到的函数at stats，但是我不知道如何对我所拥有的数据暗示错误，这样我就可以更好地运行它。有人想试试我的数据吗？

守则：

import pandas as pd
from lifelines import CoxPHFitter
Table=pd.read_csv(...)
Table['Duration']=Table['FAILURE_DATE']-Table['INSTALL_DATE']#creating 
 duration column
'''
making all durations positive
'''
Table = Table[~Table['Duration'].isnull()]

newB = []
for item in Table['Duration']:
    item_v = item
    if not isinstance(item,str) and item<0:
        item_v = abs(item)
    newB.append(item_v)

Table.loc[:, 'Duration'] = newB

'''
marking if 'death' occured 
'''
newC = []
for item in Table['InService']:
    if item==1:
        item_v = 0
    else:
        item_v = 1
    newC.append(item_v)

Table.loc[:,'watched'] = newC

cph = CoxPHFitter()

cols_to_transform = ['col1','col2',... ]
'''
creating dummy variables instead of categorical data
'''
dummies = pd.get_dummies( Table, columns = cols_to_transform )


cph.fit(dummies, 'Duration', 'watched')
cph.print_summary()

Answer 1

这个问题发生在basic.py#L412，它的生命线使用作为预拟合的检查。根据代码，输入必须至少有3。然而，在您的情况下，它没有。您的dummies变量的dummies是什么？我相信问题就在这里。