我试着运行在xcorupc_alaska上编译的Berkeley UPC代码
upcrun -n 3 -shared-heap=18GB xcorupc_alaska inputpgas0.txt我的计算机上的总内存是64 GB,我想将18 GB分配给3 CPU(它是一个四核处理器),所以它应该是可行的(使用18x3=54 GB)。但是我得到了这个错误。
UPC Runtime error: out-of-range size for UPC_SHARED_HEAP_SIZE: 18 GB
NOTICE: Before reporting bugs, run with GASNET_BACKTRACE=1 in the environment to generate a backtrace.
UPC Runtime error: out-of-range size for UPC_SHARED_HEAP_SIZE: 18 GB
NOTICE: Before reporting bugs, run with GASNET_BACKTRACE=1 in the environment to generate a backtrace.
UPC Runtime error: out-of-range size for UPC_SHARED_HEAP_SIZE: 18 GB
NOTICE: Before reporting bugs, run with GASNET_BACKTRACE=1 in the environment to generate a backtrace.知道是什么导致了这个错误,以及如何修复它吗?谢谢你的帮助。
编辑:即使对于64 bit系统,默认的每个线程的最大共享内存是16 GB。根据INSTALL.TXT中的信息,我使用标志--with-sptr-packed-bits=20,9,35重新编译。这将可能的线程数限制为2^9,但允许每个线程的2^16=32 GB最大共享内存。这解决了我的问题。
发布于 2018-06-15 16:29:58
造成此错误的最常见原因是,您构建的Berkeley UPC被配置为针对32位应用程序可执行文件,这些应用程序可执行文件不能可靠地处理每个进程超过2GB的共享堆。您可以通过检查此命令输出中的"Architecture“行来确认这一点:
upcrun -i xcorupc_alaska (或以任何BUPC可执行文件的名义交换)
鉴于您的硬件配置,我强烈建议为LP64 ABI重新构建伯克利UPC,前提是您的操作系统支持它(大多数现代操作系统都支持它)。
执行此操作的细节取决于您的翻译程序和编译器。假设您使用的是默认的在线伯克利UPC翻译程序和类似gcc的编译器套件,您可能需要一个配置行,如下所示:
$(srcdir)/configure CC='gcc -m64' CXX='g++ -m64' MPI_CC='mpicc -m64'
确保在一个新的构建目录中运行这个命令,以确保您从一个干净的模板开始。然后像往常一样构建和安装($(srcdir)/INSTALL.TXT中的详细信息)。
https://stackoverflow.com/questions/50866799
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