随机森林运行

Question

我很难理解RF代码在“随机森林”软件包中的输入之间的不同。此引用建议使用

  ## S3 method for class 'formula'
randomForest(formula, data=NULL, ..., subset, na.action=na.fail)
## Default S3 method:
randomForest(**x**,  **y** =NULL, xtest=NULL, ytest=NULL, ntree=500,

.

据我所知，x是带有预测因子的数据框架，y是响应变量。但是，我看到从同一张纸生成这个代码的例子是首先使用响应变量，然后是数据，

 iris.rf <- randomForest(Species ~ ., data=iris, importance=TRUE,
proximity=TRUE)

因此，我已经编写了我的代码有两个选项，但我不确定哪一个分类是正确的，为什么？

Here is my code: 

I am basically comparing the two codes for rf.




## create data frame 
 n   <- 199
  z   <- seq(-10, 10, length=n)
x<-sin(x)/x       
  y <-  rnorm(n, 0, 0.1)
  xy <- data.frame(x,y)


## create classes
 xy$Y<-sample(1:2,  n, replace = T)
   XY<-xy
   n <- nrow(XY)
   p <- ncol(XY)-1
   colnames(XY)[p+1]<-'Y'




## create trining and test sets
s     <- sample(sample(n)) 
    ntr   <- round(ptr*n) 
    id.tr <- s[1:ntr]
    id.te <- s[(ntr+1):n]
    XY.tr <- XY[id.tr, ]
    XY.te <- XY[id.te, ]
    y.te  <- XY[id.te, p+1]

    XY.tr$Y<-as.factor(XY.tr$Y)

##run Random forest
rf1 <- randomForest(XY.tr, data=XY.tr$Y, proximity=TRUE,importance=T) 
rf2<-randomForest(formula = XY.tr$Y ~ .,  data=XY.tr, proximity = TRUE, importance = T) 

非常感谢你对我的理解

Answer 1

两人都会给你同样的答案：

data(iris)                                                    #load data

在第一种方法中，您显式地提供响应向量y(但是相应地更正代码)：

set.seed(131)
rf1 <- randomForest(y= iris$Species, x=iris[1:4], proximity=TRUE, importance=T)  

在第二种方法中，您通过公式隐式地告知响应向量y，并提供整个数据矩阵。

set.seed(131)
rf2<-randomForest(formula = Species ~ ., data=iris, importance=TRUE, proximity=TRUE)

请参阅randomForest的R文档

论点: x，公式： 数据框架或预测器矩阵，或描述模型的公式 安装(用于打印方法，randomForest对象)。