Python -绝对气泡图

Question

我有一个12x17的数据格式，并想要创建一个像下面这样的绝对气泡图：

https://i.stack.imgur.com/IvD58.png (来自Categorical bubble plot for mapping studies)

我的数据文件基本上是这样的：

#      A     B     C
# X   0.3   0.2   0.4
# Y   0.1   0.4   0.1

我不能使用matplotlib.scatter，因为它不接受分类输入，创建假值也不起作用，因为它不是n*n，或者我可以吗？我搞不懂。我发现了seaborn.stripplot，它接受一个明确的输入，但是所有气泡的大小都是一样的，所以我被卡住了。

我怎么能在python中创造出这样一个情节呢？非常感谢。

Answer 1

我认为scatter图非常适合于创建这种绝对的气泡图。

创建dataframe：

import pandas as pd
df = pd.DataFrame([[.3,.2,.4],[.1,.4,.1]], columns=list("ABC"), index=list("XY"))

选项1:解堆栈DataFrame

dfu = df.unstack().reset_index()
dfu.columns = list("XYS")

这将创建一个类似于

   X  Y    S
0  A  X  0.3
1  A  Y  0.1
2  B  X  0.2
3  B  Y  0.4
4  C  X  0.4
5  C  Y  0.1

你可以按列来画。由于散射体的大小是点，因此需要将S列乘以一些较大的数，比如5000，才能得到大气泡。

import matplotlib.pyplot as plt
dfu["S"] *= 5000
plt.scatter(x="X", y="Y", s="S", data=dfu)
plt.margins(.4)
plt.show()

选项2:创建网格

使用例如numpy，您可以创建一个由dataframe的列和索引组成的网格，这样就可以绘制平坦网格的散点图。同样，还需要将数据的值乘以一些大的数字。

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt

x,y = np.meshgrid(df.columns, df.index)

df *= 5000
plt.scatter(x=x.flatten(), y=y.flatten(), s=df.values.flatten())
plt.margins(.4)
plt.show()

在这两种情况下，结果看起来都是

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