Bookdown添加URL作为脚注

Question

我有问题，获得正确的pdf输出的数字图例，其中包含一个网址。它的工作方式是bookdown::gitbook，而不是bookdown::pdf_book。

下面是一个示例：

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output: bookdown::pdf_book
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## Reference with URL doesn't work
In this experiment, we will use a [spectrophotometer]     (https://en.wikipedia.org/wiki/Spectrophotometry) to measure the absorption of light of different wavelength by colored solutions.

(ref:spectrum) [Spectrum of light. V, violet; B, blue; G, green Y, yellow; O,   orange; R, red](https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Linear_visible_spectrum.svg)

```{r spectrum, fig.cap='(ref:spectrum)', echo=FALSE, message=FALSE,     warning=FALSE}

knitr::include_graphics("./figures/photosynthesis/spectrum.png")

## Reference without URL does work
In this experiment, we will use a [spectrophotometer] (https://en.wikipedia.org/wiki/Spectrophotometry) to measure the absorption of light of different wavelength by colored solutions.

(ref:spectrumNOurl) Spectrum of light. V, violet; B, blue; G, green Y, yellow; O, orange; R, red.

```{r spectrumNOurl, fig.cap='(ref:spectrumNOurl)', echo=FALSE, message=FALSE,  warning=FALSE}

knitr::include_graphics("./figures/photosynthesis/spectrum.png")

我想要的是图形传奇出现在例子中，没有url，但在脚注中有一个到url的上标。

附加信息

我在MacBook Pro 13的OS (10.13.5Beta)上使用bookdown (0.7.8)、rstudio (1.1.423)和Pandoc2.1.3。

我已尽我所能解决这个问题。我将所有Pandoc的评级降到了1.x版本，这是随bookdown而来的，但也遇到了同样的问题。不管我是使用pdflatex还是xelatex作为引擎，都不重要。

Answer 1

这里有两个问题：

1.添加超链接作为脚注

默认情况下，输出LaTeX文档将不显示超链接。我们可以使用href命令重新定义LaTeX的工作方式。您可以将以下行添加到您的preamble.tex中，或者将其直接嵌入到标头中：

\let\oldhref\href 
  - \renewcommand{\href}[2]{#2\footnote{\url{#1}}}

在YAML标题中使用此方法：

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output: bookdown::pdf_book
header-includes:
  - \let\oldhref\href 
  - \renewcommand{\href}[2]{#2\footnote{\url{#1}}}
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如果您喜欢将它保存为一个单独的文件(我建议使用更大的项目)，您可以使用：

header-includes: preamble.tex

2.在标题中不起作用的文本引用

造成此问题的原因是文本引用似乎不能包含任何特殊字符，包括_和-。我将此作为另一个问题提出，因为这似乎是您问题的一个具体子问题：如果URL包含特殊字符，则Bookdown文本引用不起作用。

解决这一问题的最简单方法似乎是使用像这这样的服务缩短URL。它是免费的，链接不会过期。

这里有一个部分有效的解决方案。Stackoverflow不允许包含来自google的URL，所以您必须用链接替换缩短的URL。

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output: bookdown::pdf_book
header-includes:
  - \let\oldhref\href 
  - \renewcommand{\href}[2]{#2\footnote{\url{#1}}}
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The references work fine when not used within a text reference [Spectrum of light. V, violet; B, blue; G, green Y, yellow](https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Linear_visible_spectrum.svg)

(ref:spectrum) [Spectrum of light. V, violet; B, blue; G, green Y, yellow](Shortened URL)

```{r spectrum, fig.cap='(ref:spectrum)', echo=FALSE, message=FALSE, warning=FALSE}

阴谋(汽车)

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我说这是部分工作:正如您所看到的，我们现在有了URL的脚注，但是标题中的脚注实际上并没有显示在页脚中！

我认为你最好的选择是使用参考书目，并在@ref中引用引用的数字。检查这里：https://bookdown.org/yihui/bookdown/citations.html