如何使用grep检索行中的字符串

Question

MacOS，Unix

我试图使用grep隔离行中的特定ID，如下所示：

# STOCKHOLM 1.0

#=GS WP_002089484.1/1-154 DE [subseq from] MULTISPECIES: AAC(3)-I family aminoglycoside 3-N-acetyltransferase [Proteobacteria]

WP_002089484.1/1-154 MGIIRTCRLGPDQVKSMRAALDLFGREFGDVATYSQHQPDSDYLGNLLRSKTFIALAAFDQEAVVGALAAYVLPKFEQARSEIYIYDLAVSGEHRRQGIATALINLLKHEANALGAYVIYVQADYGDDPAVALYTKLGIREEVMHFDIDPSTAT
#=GR WP_002089484.1/1-154 PP 9*******************************************************************************************************************************************************98
#=GC PP_cons                 9*******************************************************************************************************************************************************98
#=GC RF                      xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx
//

我只想隔离显示WP_002089484.1的部分，但是我必须对许多文件这样做，在这些文件中，ID总是以"WP_“开头，并且总是以".1”结尾。我只想从每个文件中得到独特的结果。

我试过这样的方法：

grep -o "WP_.\{0,11\}" *.sto >> ProtID

但是ProtID仍然拥有原始文件中的所有信息。

Answer 1

如果只想从每个文件中出现唯一的情况，下面的命令应该会帮助您：

grep  -o  "WP_.\{0,11\}" *.sto | sort | uniq

产出如下：

file1.sto:WP_002089484.1
file2.sto:WP_002089484.1

如果您想从结果中删除文件名：

grep  -o  "WP_.\{0,11\}" *.sto | sort | uniq  | grep -o "WP_.\{0,11\}"

在这种情况下，输出将是：

WP_002089484.1
WP_002089484.1