Rscript警告消息

Question

我有一个名为making_list_313_SNPs_from_csv.R的脚本，简单地说，这个脚本接受一个.csv文件，并进行一些快速的重新安排，以生成一个.txt文件。

.csv有8列，我感兴趣的列名为: 1_11100_A_T。

我的R脚本是这样的：

library(tidyr)

setwd("/Users/m/folder/List_313/")

list = read.csv("file.csv")
list = as.data.frame(list[,2])
colnames(list) = c("SNP")

new_list = separate(data = list, col = SNP, into = c("part1", "part2", "part3", "part4"), sep = "_")
new_list = new_list[,c(1,2)]

write.table(new_list,"list_313_to_find.txt",quote=F,row.names = F, col.names = F)

我想从我的Mac终端运行这个脚本，如下所示：

 Rscript making_list_313_SNPs_from_csv.R

这是可行的，我得到一个输出文件，看起来像我想要的。但是，我得到了以下输出：

Warning message:
package ‘tidyr’ was built under R version 3.2.5 

Warning message:
In .doLoadActions(where, attach) :
  trying to execute load actions without 'methods' package

第一个警告只是对我正在使用的R包版本的警告。不过，我不知道第二次警告是甚麽意思。任何帮助都将不胜感激。

Answer 1

Rscript不加载方法包。将library(methods)添加到脚本中。一个正常的R会话自动加载它。

如果你觉得这很傻那你不是唯一一个。