我有一个XML文件,其结构类似于以下内容:
<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<drugbank xmlns="http://www.drugbank.ca" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xsi:schemaLocation="http://www.drugbank.ca http://www.drugbank.ca/docs/drugbank.xsd" version="5.0" exported-on="2017-12-20">
<drug type="biotech" created="2005-06-13" updated="2017-11-06">
<drugbank-id primary="true">DB00001</drugbank-id>
<drugbank-id>BTD00024</drugbank-id>
<drugbank-id>BIOD00024</drugbank-id>
<cas-number>138068-37-8</cas-number>
<name>Lepirudin</name>
</drug>
<drug type="biotech" created="2005-06-13" updated="2017-11-06">
<drugbank-id primary="true">DB00045</drugbank-id>
<drugbank-id>BTD00054</drugbank-id>
<drugbank-id>BIOD00054</drugbank-id>
<cas-number>205923-56-4</cas-number>
<name>Lyme disease vaccine (recombinant OspA)</name>
</drug>
</drugbank>我正在尝试利用Python3的cElementTree模块。我想提取这个XML中每种药物的名称,为此我编写了以下代码:
import xml.etree.cElementTree as ET
tree = ET.parse('fulldatabase.xml')
drugbank = tree.getroot()
print(drugbank.tag)
for drug in drugbank:
print(drug.find('name').text)我得到的错误是AttributeError: 'NoneType' object has no attribute 'text'
我也试过检查this,但是OP在其中写的答案对我无效。有没有办法让name和cas-number从每种药物中提取出来?我已经尝试过一些组合,比如在for循环条件下删除findall(),但是即使在那时,事情也没有对我起作用。
发布于 2018-04-11 15:24:19
除了名字你还需要什么吗?如果不这样就行了。您没有像文件的xml部分中定义的那样正确地使用<drugbank xmlns="http://www.drugbank.ca"命名空间
for drug in drugbank.iter('{http://www.drugbank.ca}name'):
print drug.text
Lepirudin
Lyme disease vaccine (recombinant OspA)以下是获取所需元素的另一种方法:
for child in drugbank.getchildren():
print {'cas-number': child.find('{http://www.drugbank.ca}cas-number').text, 'name': child.find('{http://www.drugbank.ca}name').text}
{'cas-number': '138068-37-8', 'name': 'Lepirudin'}
{'cas-number': '205923-56-4', 'name': 'Lyme disease vaccine (recombinant OspA)'}https://stackoverflow.com/questions/49778701
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