用ade4进行典型相关分析

Question

在R's ade4软件包中，cca功能是否被弃用？

library(ade4)
cca(mammals, environment)

输出

could not find function "cca"

我找不到关于这个错误的任何文档。

Answer 1

在cca包版本1.7-10中没有ade4函数.但是，您可以从基本的cancor中使用R，如下所示

pop <- LifeCycleSavings[, 2:3]
oec <- LifeCycleSavings[, -(2:3)]
cancor(pop, oec)

编辑的

使用以下代码安装1.7-4版本

library(devtools)
install_version("ade4", version = "1.7-4", repos = "http://cran.us.r-project.org")

然后跑

library(ade4)

Answer 2

可能不适用于最新版本的软件包。尽管如此，还是建议使用cca{vegan}，它是vegan库的组成部分。