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社区首页 >问答首页 >为什么在devtools::install_github中会出现语法错误?

为什么在devtools::install_github中会出现语法错误?
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Stack Overflow用户
提问于 2018-03-05 14:40:05
回答 2查看 858关注 0票数 4

我刚开始使用linux。我正在尝试使用dropEst管线https://github.com/hms-dbmi/dropEst#dropreport来分析测序数据。我想运行DropReport,为此我需要安装dropEstR包。

我试过:

代码语言:javascript
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devtools::install_github('hms-dbmi/dropEst/dropestr' , dependencies = T) 

正如他们所建议的,我也认为这是个错误:

bash:意外令牌‘’hms-dbmi/dropEst/dropestr‘附近的语法错误,

你知道我该怎么做吗?

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回答 2

Stack Overflow用户

发布于 2018-03-05 16:50:27

我认为你使用的是“错误的”外壳。当您想要使用devtools包时,您必须使用R/RStudio。来自克莱恩:

使开发R包更容易的标题工具

我刚刚在RStudio中尝试了您的命令,但是安装最终失败了:

代码语言:javascript
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ERROR: dependency 'Rcpp' is not available for package 'dropestr'
* removing 'C:/R/R-3.4.2/library/dropestr'
Installation failed: Command failed (1)
票数 3
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Stack Overflow用户

发布于 2021-12-17 15:12:21

您必须在RStudio上运行这样的脚本,以便R.导入您的项目并运行它。

你可以从在这里输入链接描述下载它

编码愉快。

票数 0
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页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持
原文链接:

https://stackoverflow.com/questions/49112917

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