有没有一种使用Ibis (impala)迭代表行的方法？

Question

我有一个相当大的Ibis TableExpr，我想对它的各行进行迭代，以生成一个专门的文件输出(FASTA核苷酸序列)。有没有办法用Ibis来实现这一点，或者我应该只调用execute来创建一个可以调用DataFrame的pandas iterrow？

我在API或教程中找不到任何内容。

Answer 1

您应该像您所说的那样遍历熊猫DataFrame。

或者，您还应该能够获得后端调用比.execute()更低级别的函数时生成的Impyla游标。但是，当我们发布IBIS2.0时，这些函数可能会发生变化，因此您的代码可能会崩溃。

如果你对此感兴趣，我很乐意收到反馈。您可以在项目GitHub中打开问题。