我有很多公式,作为字符串,我想在glm中一次使用一个公式,最好使用tidyverse函数。这就是我现在的处境。
library(tidyverse)
library(broom)
mtcars %>% dplyr::select(mpg:qsec) %>% colnames -> targcols
paste('vs ~ ', targcols) -> formulas
formulas
#> 'vs ~ mpg' 'vs ~ cyl' 'vs ~ disp' 'vs ~ hp' 'vs ~ drat' 'vs ~ wt' 'vs ~ qsec' 我可以用这些公式中的任何一个来运行一个一般的线性模型
glm(as.formula(formulas[1]), family = 'binomial', data = mtcars) %>% glance
#> null.deviance, df.null, logLik, AIC, BIC, deviance, df.residual
#> 43.86011, 31, -12.76667, 29.53334, 32.46481, 25.53334, 30 我想用列表中所有可能的公式来运行glm。我试过这样做的。
data.frame(formulas = formulas) %>%
mutate(mod = map(formulas, function(fs){
glm(as.formula(fs), family = 'binomial', data = mtcars)
}))但是,我得到以下错误消息:
Mutate_impl中的错误(.data,dots):评估错误:无效公式。追溯: 1. data.frame(公式=公式) %>%变异(mod=map(公式),。函数(Fs){.glm(as.formula(fs),系列=“二项式”,data =mtcar)。3. withVisible(eval(quote(
\_fseq(\_lhs)),(\_fseq(\_lhs),env,env) 4. env(\_fseq(\_lhs)),env,env) 5.\_fseq(\_lhs) 6.免费(值,\_function\_list) 7. withVisible(function_list[k]) 8. function_list[k] 9.变异(.,mod =map(公式,函数(Fs)){.glm(as.formula(fs),系列=“二项式”,data =mtcar)。) mutate.data.frame(.,mod =map(公式,函数(Fs){。glm(as.formula(fs),系列=“二项式”,data =mtcar)。)as.data.frame(变异(tbl_df(.data),.) 12.变异(tbl_df(.data),.) 13. mutate.tbl_df(tbl_df(.data),.) 14. mutate_impl(.data,dots)
有人能告诉我我在这里错过了什么吗?谢谢你的建议。
发布于 2018-01-25 19:17:53
问题在于您使用的是data.frame();我不能百分之百确定为什么这不工作,但我认为这是因为数据帧不能顺利地处理列表列。
将data.frame改为tibble对我有用。(它来自tibble包,也是通过dplyr导出的,因此应该可以在library("tidyverse")之后使用)
您可以将代码缩短一点:
tibble(formulas) %>%
mutate(mod = map(formulas,
~ glm(as.formula(.),
family = 'binomial', data = mtcars)))https://stackoverflow.com/questions/48450308
复制相似问题