jupyterhub和conda环境

Question

我对conda环境和jupyterhub之间的关系有点困惑。

正如jupyterhub文档所述，它可以从conda安装。因此，可以使用某些conda环境(例如，环境"root")并从它执行“”。

在同样的环境下，将“活”的朱庇特。在此环境中安装nb_conda可以在笔记本中选择内核和其他conda环境。

我的问题是关于软件，如and扩展和ipywidget。他们应该在哪里？在与jupyterhub相同的环境中，还是在新笔记本的环境中？

Answer 1

conda和jupyter之间的关系可能是一个混乱的关系。将conda视为您的环境，将jupyter视为任何其他包。一个包，您可以使用该包启动进程，然后提供服务。

要回答您的问题，它们应该安装在您的conda环境中。不幸的是，它比这要复杂一些。所有用户都可以使用这些扩展。我个人还没有在不同的环境中测试过一个拥有更多扩展的用户(如果可能的话，但如果可能的话，我会更新答案)。

如果有帮助的话，这就是医生们要说的话：

要安装jupyter_contrib_nbextensions笔记本扩展，需要三个步骤。首先，需要安装Python包。然后，笔记本扩展本身需要复制到木星数据目录。最后，可以通过使用内置的木星命令启用已安装的笔记本扩展，也可以通过使用jupyter_nbextensions_configurator服务器扩展来更方便地启用该扩展，该扩展是作为此回购的依赖项安装的。

假设您通过conda安装了扩展程序

conda install -c conda-forge jupyter_contrib_nbextensions

然后使用--sys-prefix，这是很好的。从医生那里：

将--sys-prefix安装到python的sys.prefix中，例如在虚拟环境中很有用，比如使用conda。

因此，要添加一个扩展，流程应该如下所示：

$ sudo su -
$ pip install fileupload
$ jupyter nbextension install --sys-prefix --py fileupload
$ jupyter nbextension enable fileupload --py --sys-prefix

因为标题是询问conda环境，所以我也会讨论这个问题。我已经在Ubuntu18.04LTS上测试了这些方法。

通常，您会希望允许用户共享用户创建的环境，而不允许用户访问根权限。您有两个很好的选项，我已经看到(有人请评论，如果您知道其他方法)：1)共享一个环境，2)复制一个环境的需求文件。不要忘记，您还必须添加环境作为内核。

方法1-共享环境

在共享位置创建一个环境，然后让两个用户将其作为内核添加。

conda create -p /home/envs/test --clone root

可以克隆根以复制根env，也可以复制基环境的基。/home/envs/test将在"envs“目录中创建一个"test”环境。确保env对将要使用这些文件的用户具有所有必要的权限。

从那里作为另一个用户，只需添加环境作为内核。

$ sudo su - <user-to-install-kernel-to>
$ conda activate <test>
$ python -m ipykernel install --user --name test \
         --display-name "Python (test)"

注意..。我相信我必须手动更新内核规范才能使它指向正确的python环境‍♂️。

方法2

或者，只创建环境的副本。

$ conda env export --name test > environment.yml
$ sudo su - customer
$ conda env create --name cust-env-copy --file environment.yml
$ python -m ipykernel install --user --name cust-env-copy \
         --display-name "Python (test)"