R:将行与公共信息结合起来

Question

我有这样一个数据框架：

V1 V2  V3    V4    V5  V6  V7 V8            V9
1  .  mRNA  1300  9000  .  +  .  ID=mRNA00003;Parent=gene00001;Name=EDEN.3
1  .  exon  1300  1500  .  +  .  ID=exon00001;Parent=mRNA00001
1  .  exon  1300  1500  .  +  .  ID=exon00001;Parent=mRNA00002
1  .  exon  1300  1500  .  +  .  ID=exon00001;Parent=mRNA00003

由于最后3行共享的信息大部分相同(即前8列是相同的)，所以我想让它们像这样：

V1 V2  V3    V4    V5  V6  V7 V8            V9
1  .  mRNA  1300  9000  .  +  .  ID=mRNA00003;Parent=gene00001;Name=EDEN.3
1  .  exon  1300  1500  .  +  .  ID=exon00001;Parent=mRNA00001;mRNA00002;mRNA00003

有什么简单的方法吗？

Answer 1

有点像？

library(dplyr)
df %>%
  group_by(V1,V2,V3,V4,V5,V6,V7,V8) %>%
  summarise(V9 = paste(unique(unlist(strsplit(paste(V9, collapse = ';'), split = ";"))),collapse=";"))

Answer 2

根据注释，您还可以尝试使用aggregate(V9 ~ ., df, function(x){paste(x, sep = ";")})