如何使用Minimizer对象来最小化函数调用的#。我从日志中得到了这样的信息:
太多的函数调用(最大设置为%i)!使用:最小化(func,params,.,maxfev=NNN)或设置最小值to _kws\‘maxfev\’以增加这个最大值。
from numpy import sqrt, pi, exp, loadtxt
from lmfit import Model
from lmfit import Minimizer
import matplotlib.pyplot as plt
data = loadtxt('data/model1d_gauss.dat')
x = data[:, 0]
y = data[:, 1]
def gaussian(x, amp, cen, wid):
"1-d gaussian: gaussian(x, amp, cen, wid)"
return (amp/(sqrt(2*pi)*wid)) * exp(-(x-cen)**2 /(2*wid**2))
gmodel = Model(gaussian)
result = gmodel.fit(y, x=x, amp=5, cen=1, wid=1,method= 'least_squares')
print(result.fit_report())
r = result.fit_report()
plt.plot(x, y, 'bo')
plt.plot(x, result.init_fit, 'k--')
plt.plot(x, result.best_fit, 'r-')
plt.show()lmfit文档链接
我想通过最小化函数调用来使拟合更快(很多数据都是杂乱的废话)
发布于 2017-12-13 20:04:03
不确定我是否推荐这样做,但是由于您在内部使用的是正方形,您可以只传递所需的选项,例如:
result = gmodel.fit(y, x=x, amp=5, cen=1, wid=1,method='least_squares',
fit_kws={'max_nfev': 100})当然,这是假定的,在观察maxiter reached状态之后,lmfit将接受状态。但从你的问题听起来,这只是作为警告。
请记住,这个优化器是基于容差准则(见docs),当不收敛给定x步骤数时,它实际上认为它仍然可以改进最小化!
正如评论中所问的那样:是的,你也可以改变这些标准,例如:
result = gmodel.fit(y, x=x, amp=5, cen=1, wid=1,method='least_squares',
fit_kws={'ftol': 1-07, # default 1e-08
'xtol': 1-07, # 1e-08
'gtol': 1-07}) # 1e-08https://stackoverflow.com/questions/47801096
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