Python将整个文件作为一行读取

Question

我有一个数据文件，如下所示。

Index   Code    Pos1    Strand  Chr2    Pos2    length  blocks
1   G32_bkd.ctx:Vu01(old4)  62739   47+9-   Vu01(old4)  63651   790 0
2   G32_bkd.ctx:Vu01(old4)  441403  10+0-   Vu01(old4)  446263  4893    0
3   G32_bkd.ctx:Vu01(old4)  450546  15+0-   Vu01(old4)  451091  576 0
4   G32_bkd.ctx:Vu01(old4)  459741  10+0-   Vu01(old4)  460841  1068    0
5   G32_bkd.ctx:Vu01(old4)  612262  14+0-   Vu01(old4)  629013  16788   0
6   G32_bkd.ctx:Vu01(old4)  688380  23+0-   Vu01(old4)  693207  4872    0
7   G32_bkd.ctx:Vu01(old4)  730643  12+0-   Vu01(old4)  740497  7011    0
8   G32_bkd.ctx:Vu01(old4)  834116  16+1-   Vu01(old4)  835797  1752    0

我想分开读标题行，然后在for循环中读取每一行。我的代码是

with open(file) as f:
    title_line = f.readline()
    for line in f:
        line = line.strip()
        cols = line.split()

当我在print(line)循环中检查for时，它没有打印任何东西。但是，当我检查print(title_line)时，整个文件是打印出来的，保持文件中的确切格式。哪里出了问题？

注:所以，我只是复制和粘贴整个文件，并以不同的名称保存它，它工作得很好。

Answer 1

可能导致这种行为的一件事是，如果Python出于某种原因不喜欢原始文件中行字符的末尾。

要确认这一点，您可以在Linux上使用od -t a file | less，并检查其中的内容。也许该文件符合不同的操作系统标准？如果不在Linux上，则可以使用Python本身使用ord打印每个字符，以查看它正在使用什么(\n、\r、\r\n)。

如果是这样的话，你有一些选择：

• 对于Python 2，可以以通用换行符模式打开文件。即"U"：
  • open (file, "U")
  • 这是一种快速而简单的方法来确认这确实是问题所在，并解决它，但长期不推荐。

​

• 否则，您可以使用io.open而不是open，并使用它的newline=参数。默认的None应该是您所需要的。

如果这不能解决您的问题，请提供：

• 你使用的操作系统
• 您正在使用的Python版本
• 原始文件的源操作系统。

作为一个无关的附带说明，我建议您检查Python的内置csv模块来读取您的文件。这似乎非常合适( csv模块可以配置为使用空格或制表符，而不是逗号)

参考资料

• https://docs.python.org/2/library/functions.html#open
• https://docs.python.org/2/glossary.html#term-universal-newlines
• https://docs.python.org/2/library/io.html#io.open

Answer 2

假设您有一个文件'yourfile.txt‘，并且它的大小不是很大。

f = open('yourfile.txt','r')  

跳过读行中的title_line。

for line in f.readlines()[1:]:
    line = line.strip()
    cols = line.split()
    # output the result
    print ",".join(x for x in cols)